RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 SMYD3Q9H7B4 428 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP2-220ENST00000511663 GREB1Q4ZG55 1949 aa20.44■□□□□ 0.86
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SH3BP2-220ENST00000511663 PDXKO00764 312 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-220ENST00000511663 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
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SH3BP2-220ENST00000511663 MYL1P05976 194 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-220ENST00000511663 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
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SH3BP2-220ENST00000511663 CEP135Q66GS9 1140 aa20.43■□□□□ 0.86
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SH3BP2-220ENST00000511663 TAF4BQ92750 862 aa20.43■□□□□ 0.86
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SH3BP2-220ENST00000511663 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-220ENST00000511663 MMP17Q9ULZ9 603 aa20.43■□□□□ 0.86
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SH3BP2-220ENST00000511663 CAVIN2O95810 425 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-220ENST00000511663 NR3C1P04150 777 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-220ENST00000511663 ADH5P11766 374 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC6A11P48066 632 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-220ENST00000511663 CRY1Q16526 586 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-220ENST00000511663 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
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SH3BP2-220ENST00000511663 TPSD1Q9BZJ3 242 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-220ENST00000511663 FBXO44Q9H4M3 255 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-220ENST00000511663 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGEF4Q9NR80 690 aa20.42■□□□□ 0.86
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SH3BP2-220ENST00000511663 DMAC2Q9NW81 257 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-220ENST00000511663 IKBKBO14920 756 aa20.41■□□□□ 0.86
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SH3BP2-220ENST00000511663 TUBP50607 506 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC5A3P53794 718 aa20.41■□□□□ 0.86
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SH3BP2-220ENST00000511663 FRYLO94915 3013 aa20.41■□□□□ 0.86
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SH3BP2-220ENST00000511663 SPATA32Q96LK8 384 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-220ENST00000511663 SMOC1Q9H4F8 434 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-220ENST00000511663 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-220ENST00000511663 IL37Q9NZH6 218 aa20.4■□□□□ 0.86
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SH3BP2-220ENST00000511663 TNFRSF10BO14763 440 aa20.39■□□□□ 0.85
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SH3BP2-220ENST00000511663 MAP3K7CLP57077 242 aa20.39■□□□□ 0.85
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SH3BP2-220ENST00000511663 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa20.39■□□□□ 0.85
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SH3BP2-220ENST00000511663 GAB4Q2WGN9 574 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 ANO4Q32M45 955 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 ZACNQ401N2 412 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 PAQR9Q6ZVX9 377 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 SV2AQ7L0J3 742 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 RASSF3Q86WH2 238 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 FUKQ8N0W3 1084 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 CRYBG2Q8N1P7 616 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 PGBD3Q8N328 593 aa20.39■□□□□ 0.85
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SH3BP2-220ENST00000511663 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC150Q8NCX0 1101 aa20.39■□□□□ 0.85
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