RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MTHFD1LQ6UB35 978 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NAPRTQ6XQN6 538 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF804AQ7Z570 1209 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 YAF2Q8IY57 180 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABHD11Q8NFV4 315 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BRIP1Q9BX63 1249 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SH3BP4Q9P0V3 963 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa5.51□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AGPSO00116 658 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AP4M1O00189 453 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RGS10O43665 173 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PIAS2O75928 621 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDE8BO95263 885 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A1BGP04217 495 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HGFP14210 728 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIM27P14373 513 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IL1R2P27930 398 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EPHA3P29320 983 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF543Q08ER8 600 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DAG1Q14118 895 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PROSER3Q2NL68 480 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COBLL1Q53SF7 1204 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTF1AQ7RTS3 328 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CTHRC1Q96CG8 243 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VN1R3Q9BXE9 311 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM83DQ9H4H8 585 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AS3MTQ9HBK9 375 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USP22Q9UPT9 525 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CORO2BQ9UQ03 480 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNX13Q9Y5W8 968 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RHPN2P1A8MT19 583 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 APAF1O14727 1248 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PMPCBO75439 489 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IL18RAPO95256 599 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRKCGP05129 697 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TPH1P17752 444 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GKP32189 559 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABCG1P45844 678 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CASP5P51878 434 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PSG6Q00889 435 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM50BQ9Y247 325 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AQP7P3A6NL99 342 aa5.48□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LINC01548A6NM66 108 aa5.48□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TISP43B9A030 160 aa5.48□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 INMTO95050 263 aa5.48□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LATS1O95835 1130 aa5.48□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FPR3P25089 353 aa5.48□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GNALP38405 381 aa5.48□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GATMP50440 423 aa5.48□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP5.48□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNAB1Q14722 419 aa5.48□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP5.48□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIM72Q6ZMU5 477 aa5.48□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa5.48□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF152Q8N8N0 203 aa5.48□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYP2W1Q8TAV3 490 aa5.48□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDYHV1Q96HA8 205 aa5.48□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF212Q9UDV6 495 aa5.48□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VPS51Q9UID3 782 aa5.48□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AMFRQ9UKV5 643 aa5.48□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A087WZ62 844 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 M0R3H8 397 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PSMD9O00233 223 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KPNA5O15131 536 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPRY2O43597 315 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FGAP02671 866 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TSHRP16473 764 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRIM2P49643 509 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PGDP52209 483 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAPK7Q13164 816 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STK3Q13188 491 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM119Q4V9L6 283 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MANEALQ5VSG8 457 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIRREL2Q6UWL6 708 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF44Q7L0R7 432 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SFTPA1Q8IWL2 248 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 METTL25Q8N6Q8 603 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SIRT6Q8N6T7 355 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VGLL2Q8N8G2 317 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TERB1Q8NA31 727 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATP11CQ8NB49 1132 aa5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms