RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490051.1

GRB10-222, Transcript of growth factor receptor bound protein 10, human

TSL 4

Gene GRB10, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRB10-222	ENST00000490051	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	RLN3	Q8WXF3	142 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	FBXO32	Q969P5	355 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	WBP2	Q969T9	261 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	BACH2	Q9BYV9	841 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	VPS45	Q9NRW7	570 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	KRT82	Q9NSB4	513 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	LNP1	A1A4G5	178 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	SGK1	O00141	431 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	COCH	O43405	550 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	F13A1	P00488	732 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	ADH5	P11766	374 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	YWHAQ	P27348	245 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	LIMK1	P53667	647 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	SLC5A3	P53794	718 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	DLG4	P78352	724 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	ST3GAL2	Q16842	350 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	EMC10	Q5UCC4	262 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	PMS2CL	Q68D20	193 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	ACOT1	Q86TX2	421 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	FRMD1	Q8N878	549 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	NAT16	Q8N8M0	369 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	EHD2	Q9NZN4	543 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	GMIP	Q9P107	970 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	EBF1	Q9UH73	591 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	TMEM131	Q92545	1883 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	C4orf47	A7E2U8	309 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	GIPC1	O14908	333 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	BEST1	O76090	585 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	RHOBTB1	O94844	696 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	KAT7	O95251	611 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	VNN1	O95497	513 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	CAVIN2	O95810	425 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	PGF	P49763	221 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	NCOA4	Q13772	614 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	CRY1	Q16526	586 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	RESP18	Q5W5W9	173 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	NUP93	Q8N1F7	819 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	PNKP	Q96T60	521 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	CKAP5	Q14008	2032 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	TM4SF5	O14894	197 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	TRIM24	O15164	1050 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	KLRC4	O43908	158 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	AP1G2	O75843	785 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	KCNK5	O95279	499 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	ADH1C	P00326	375 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	APOD	P05090	189 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	PFKL	P17858	780 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	STK4	Q13043	487 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	RASSF3	Q86WH2	238 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	FUK	Q8N0W3	1084 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GRB10-222	ENST00000490051	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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