RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489977.5

SKAP2-206, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 679 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-206ENST00000489977 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
SKAP2-206ENST00000489977 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
SKAP2-206ENST00000489977 TMEM184CQ9NVA4 438 aa4.66□□□□□ -1.66
SKAP2-206ENST00000489977 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.65□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 H3BML4 177 aa4.65□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 PSMD9O00233 223 aa4.65□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 SPRY2O43597 315 aa4.65□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 KITP10721 976 aa4.65□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 DIO1P49895 249 aa4.65□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 ZNF91Q05481 1191 aa4.65□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 MIDNQ504T8 468 aa4.65□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 CERCAMQ5T4B2 595 aa4.65□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 B3GNT9Q6UX72 402 aa4.65□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 DEF8Q6ZN54 512 aa4.65□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 DENND1CQ8IV53 801 aa4.65□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 OR6B3Q8NGW1 331 aa4.65□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 DNAJB14Q8TBM8 379 aa4.65□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 MAML1Q92585 1016 aa4.65□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 CUL5Q93034 780 aa4.65□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 MARK4Q96L34 752 aa4.65□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa4.65□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa4.65□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa4.65□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa4.65□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 TTC3P53804 2025 aa4.64□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 FAM90A10PA6NDY2 464 aa4.64□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 CD8B2A6NJW9 211 aa4.64□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 M0R3H8 397 aa4.64□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 ALPLP05186 524 aa4.64□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 THBS3P49746 956 aa4.64□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 CFHR1Q03591 330 aa4.64□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 SLC13A2Q13183 592 aa4.64□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 C4orf46Q504U0 113 aa4.64□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 TMTC4Q5T4D3 741 aa4.64□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 DCAF12L1Q5VU92 463 aa4.64□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 TRIM5Q9C035 493 aa4.64□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 HEY2Q9UBP5 337 aa4.64□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 CDY1Q9Y6F8 540 aa4.64□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa4.64□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 TBC1D4O60343 1298 aa4.63□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 IGSF3O75054 1194 aa4.63□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 PHKG2P15735 406 aa4.63□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 UQCRC1P31930 480 aa4.63□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 TIRAPP58753 221 aa4.63□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 TMEM65Q6PI78 240 aa4.63□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 RANBP10Q6VN20 620 aa4.63□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa4.63□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 DAAM2Q86T65 1068 aa4.63□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa4.63□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 SPARTQ8N0X7 666 aa4.63□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 MPP5Q8N3R9 675 aa4.63□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 KAZALD1Q96I82 304 aa4.63□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 CAMK1GQ96NX5 476 aa4.63□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa4.63□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 ZSCAN32Q9NX65 697 aa4.63□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 USP22Q9UPT9 525 aa4.63□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 A0A1W2PPL8 197 aa4.62□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 OAZ2O95190 189 aa4.62□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 CTSAP10619 480 aa4.62□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 CREB1P16220 341 aa4.62□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP4.62□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 ID2Q02363 134 aa4.62□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa4.62□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP4.62□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 OR56A3Q8NH54 315 aa4.62□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 IL31RAQ8NI17 732 aa4.62□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 SLC35G2Q8TBE7 412 aa4.62□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 WDYHV1Q96HA8 205 aa4.62□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 VN1R3Q9BXE9 311 aa4.62□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 PI4KBQ9UBF8 816 aa4.62□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 MGAT4CQ9UBM8 478 aa4.62□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 SRGAP2O75044 1071 aa4.61□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 TOMM40O96008 361 aa4.61□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 EN2P19622 333 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 SCP2P22307 547 aa4.61□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 EPHA3P29320 983 aa4.61□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 PRKAR1BP31321 381 aa4.61□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 RAB32Q13637 225 aa4.61□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 DCDC5Q6ZRR9 648 aa4.61□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 MICU3Q86XE3 530 aa4.61□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 POT1Q9NUX5 634 aa4.61□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 AGPSO00116 658 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 TBX3O15119 743 aa4.6□□□□□ -1.67
SKAP2-206ENST00000489977 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms