RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GDF10P55107 478 aa16.23■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CAP1Q01518 475 aa16.23■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa16.23■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XYLT1Q86Y38 959 aa16.23■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WNT8BQ93098 351 aa16.23■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM109Q9BVC6 243 aa16.23■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IP6K2Q9UHH9 426 aa16.23■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCN4AP35499 1836 aa16.23■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa16.22■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNAJC3Q13217 504 aa16.22■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PMF1Q6P1K2 205 aa16.22■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM72Q6ZMU5 477 aa16.22■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KATNAL2Q8IYT4 538 aa16.22■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EXD1Q8NHP7 514 aa16.22■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa16.22■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GOLGA8RI6L899 631 aa16.22■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LIASO43766 372 aa16.22■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL18RAPO95256 599 aa16.22■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CALB1P05937 261 aa16.22■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RARBP10826 455 aa16.22■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP5DP30049 168 aa16.22■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAP2K5Q13163 448 aa16.22■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLCO2A1Q92959 643 aa16.22■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RMDN2Q96LZ7 410 aa16.22■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BCO2Q9BYV7 579 aa16.22■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ECT2Q9H8V3 914 aa16.22■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDH16O75309 829 aa16.21■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAB27AP51159 221 aa16.21■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBC1D25Q3MII6 688 aa16.21■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa16.21■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa16.21■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HOMEZQ8IX15 550 aa16.21■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PEBP4Q96S96 227 aa16.21■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa16.21■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SUN1O94901 812 aa16.21■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYCP01106 439 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AP3M2P53677 418 aa16.21■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CRHR2Q13324 411 aa16.21■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP16.21■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SURF1Q15526 300 aa16.21■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa16.21■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPATA21Q7Z572 469 aa16.21■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTC30AQ86WT1 665 aa16.21■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A8MUI8 341 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CST8O60676 142 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TJP3O95049 919 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FGFR1P11362 822 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LCP1P13796 627 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLRC2P26717 231 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FOXN2P32314 431 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC8A1P32418 973 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPD2P43304 727 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RANBP1P43487 201 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM74Q86UV6 250 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM73Q86UV7 250 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RASAL3Q86YV0 1011 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GABRQQ9UN88 632 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDH23Q9H251 3354 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 I3L4J1 428 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLDN5O00501 218 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MIPP30301 263 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITIH4Q14624 930 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EXOC8Q8IYI6 725 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PITPNM3Q9BZ71 974 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NOD2Q9HC29 1040 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A1W2PPM1 405 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTC36A6NLP5 189 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GABBR2O75899 941 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSEN2P49810 448 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RBP5P82980 135 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNX17Q15036 470 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GNASQ5JWF2 1037 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IQSEC1Q6DN90 963 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRPV1Q8NER1 839 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CKAP2Q8WWK9 683 aa16.2■□□□□ 0.18
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A8MXQ7 604 aa16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms