RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486941.1

SNRNP40-205, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40, human

TSL 2

Gene SNRNP40, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP40-205	ENST00000486941	MCAM	P43121	646 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	GPR3	P46089	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	VAV2	P52735	878 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	CACNB3	P54284	484 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	GYS2	P54840	703 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	SCAND1	P57086	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLFN5	Q08AF3	891 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	STRN3	Q13033	797 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	GEN1	Q17RS7	908 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	C17orf99	Q6UX52	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	DRC7	Q8IY82	874 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM151A	Q8WW52	585 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	USP44	Q9H0E7	712 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	CASS4	Q9NQ75	786 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	MYADML2	A6NDP7	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	EYA2	O00167	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	CXCL11	O14625	94 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	GPANK1	O95872	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	C1R	P00736	705 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	CKB	P12277	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC5A1	P13866	664 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC6A4	P31645	630 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	PSMC4	P43686	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ATP8B2	P98198	1209 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	LNX2	Q8N448	690 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	LPIN2	Q92539	896 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	FATE1	Q969F0	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ASB6	Q9NWX5	421 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	PTPRC	P08575	1304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	PTPRF	P10586	1907 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941		H0YGN5	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	PDHX	O00330	501 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ENPP3	O14638	875 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ULK1	O75385	1050 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	CIAO1	O76071	339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	GJB1	P08034	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	CAPN2	P17655	700 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	CTGF	P29279	349 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	MTM1	Q13496	603 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	RAET1E	Q8TD07	263 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	TTC1	Q99614	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	CPA4	Q9UI42	421 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	DOCK2	Q92608	1830 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	BRCA2	P51587	3418 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ENTPD3	O75355	529 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	PER3	P56645	1201 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	UBXN2A	P68543	259 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	TCP10	Q12799	353 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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