RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486016.1

GCFC2-209, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 3

Gene GCFC2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-209	ENST00000486016	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	DAAM2	Q86T65	1068 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	TMEM232	C9JQI7	657 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016		H3BNC9	293 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	DSCR3	O14972	297 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	KIT	P10721	976 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	UQCRC1	P31930	480 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	SLC13A2	Q13183	592 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	MLC1	Q15049	377 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	OR56A3	Q8NH54	315 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	MAP4K1	Q92918	833 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	CCDC17	Q96LX7	622 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	EBF3	Q9H4W6	596 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016		A0A1W2PPL8	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	CES2	O00748	559 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	AKAP10	O43572	662 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	TUSC2	O75896	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	PLCD1	P51178	756 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	TIRAP	P58753	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	CFHR1	Q03591	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	TPH2	Q8IWU9	490 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	TBX3	O15119	743 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	GCAT	O75600	419 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	SNHG28	P0DPA3	235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	HSPA6	P17066	643 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	GHRHR	Q02643	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	RAB32	Q13637	225 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	NPY5R	Q15761	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	NPNT	Q6UXI9	565 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	STK32B	Q9NY57	414 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	USP19	O94966	1318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	PSMD9	O00233	223 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	TBC1D4	O60343	1298 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	TLR2	O60603	784 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	PHKG2	P15735	406 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	EPHA3	P29320	983 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	CCKAR	P32238	428 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	RAB27A	P51159	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	E2F8	A0AVK6	867 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	MYMK	A6NI61	221 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	AGPS	O00116	658 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	RFPL1	O75677	317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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