RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 MICU3Q86XE3 530 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 GALNT4Q8N4A0 578 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 RSPRY1Q96DX4 576 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 RITA1Q96K30 269 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 C5orf34Q96MH7 638 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 SNX18Q96RF0 628 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 MMS19Q96T76 1030 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 A6NNZ2 444 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 CCP110O43303 1012 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 RRP9O43818 475 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 PMPCBO75439 489 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 PIAS2O75928 621 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 LATS1O95835 1130 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 PEX2P28328 305 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 UQCRC1P31930 480 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 GKP32189 559 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 ARHGAP25P42331 645 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 FMO1Q01740 532 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 ARHGEF7Q14155 803 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC29A2Q14542 456 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 DENND2CQ68D51 928 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 YAF2Q8IY57 180 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 SNX15Q9NRS6 342 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-210ENST00000485459 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 KCNU1A8MYU2 1149 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 TPP1O14773 563 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 FGAP02671 866 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 HGFP14210 728 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 CREB1P16220 341 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 TPH1P17752 444 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 PGDP52209 483 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM193AP78312 1265 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP1-1Q07627 177 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 GRM3Q14832 879 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 MORN5Q5VZ52 161 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC2A7Q6PXP3 512 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 SFTPA1Q8IWL2 248 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 APIPQ96GX9 242 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC17Q96LX7 622 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 VN1R3Q9BXE9 311 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 TRIM5Q9C035 493 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 BHMT2Q9H2M3 363 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 PDGFCQ9NRA1 345 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 LPAR3Q9UBY5 353 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 INMTO95050 263 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 ZBED1O96006 694 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 MYF5P13349 255 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 PHKG2P15735 406 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 ATF3P18847 181 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 ACVR2AP27037 513 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 MMP13P45452 471 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 CPT1AP50416 773 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 COPB1P53618 953 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 ETFDHQ16134 617 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM187BQ17R55 369 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 PTCHD4Q6ZW05 846 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 C8orf58Q8NAV2 365 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 DENND1AQ8TEH3 1009 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 SCARB1Q8WTV0 552 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 HS6ST2Q96MM7 605 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 MID2Q9UJV3 735 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 WDR17Q8IZU2 1322 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 AQP7P3A6NL99 342 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM232C9JQI7 657 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 EXOC5O00471 708 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 RNF8O76064 485 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 GATMP50440 423 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 PSG6Q00889 435 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms