RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485019.1

RBM34-208, Transcript of RNA binding motif protein 34, human

TSL 3

Gene RBM34, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM34-208	ENST00000485019	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	NACA2	Q9H009	215 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	MIS12	Q9H081	205 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	LHX5	Q9H2C1	402 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	NAGPA	Q9UK23	515 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	USP3	Q9Y6I4	520 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019		A0A1W2PQH9	124 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019		A0A1W2PQJ5	194 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	FAM92A	A1XBS5	289 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	C2orf78	A6NCI8	922 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	AP5Z1	O43299	807 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	ZBED1	O96006	694 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	CKM	P06732	381 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	ASGR2	P07307	311 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	TPM1	P09493	284 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	HDC	P19113	662 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	ACADSB	P45954	432 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	CDR2	Q01850	454 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	POTEH	Q6S545	545 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	PARM1	Q6UWI2	310 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	RNF135	Q8IUD6	432 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	TTC16	Q8NEE8	873 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	STK32A	Q8WU08	396 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	ASB16	Q96NS5	453 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	SYNC	Q9H7C4	482 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	KCNK12	Q9HB15	430 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	FAM170A	A1A519	330 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	SOBP	A7XYQ1	873 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	RALA	P11233	206 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	CASP14	P31944	242 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	PSEN1	P49768	467 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	SNX16	P57768	344 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	ZBED6	P86452	979 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	PDCL	Q13371	301 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	TRIM14	Q14142	442 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	HECTD3	Q5T447	861 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	VSTM4	Q8IW00	320 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	GOLGA1	Q92805	767 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	FGF14	Q92915	247 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	NXPE3	Q969Y0	559 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	AGPAT1	Q99943	283 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	KXD1	Q9BQD3	176 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	CD320	Q9NPF0	282 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	NCAN	O14594	1321 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM34-208	ENST00000485019		E5RJQ4	531 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM34-208	ENST00000485019	ANHX	E9PGG2	379 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM34-208	ENST00000485019	ECI2	O75521	394 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM34-208	ENST00000485019	FBXO21	O94952	628 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM34-208	ENST00000485019	GYPC	P04921	128 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM34-208	ENST00000485019	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM34-208	ENST00000485019	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RBM34-208	ENST00000485019	RARG	P13631	454 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM34-208	ENST00000485019	PFKL	P17858	780 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM34-208	ENST00000485019	TNFAIP3	P21580	790 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM34-208	ENST00000485019	VIPR2	P41587	438 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM34-208	ENST00000485019	PGF	P49763	221 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM34-208	ENST00000485019	DAOA	P59103	153 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM34-208	ENST00000485019	FMO1	Q01740	532 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM34-208	ENST00000485019	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM34-208	ENST00000485019	HTR4	Q13639	388 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM34-208	ENST00000485019	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM34-208	ENST00000485019	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM34-208	ENST00000485019	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM34-208	ENST00000485019	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM34-208	ENST00000485019	TMC6	Q7Z403	805 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM34-208	ENST00000485019	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM34-208	ENST00000485019	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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