RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484528.1

USP40-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-215ENST00000484528 TMEM174Q8WUU8 243 aa22.87■■□□□ 1.25
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USP40-215ENST00000484528 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.87■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.86■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 TNFRSF10BO14763 440 aa22.86■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 COCHO43405 550 aa22.86■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 BEST1O76090 585 aa22.86■■□□□ 1.25
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USP40-215ENST00000484528 DPYDQ12882 1025 aa22.86■■□□□ 1.25
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USP40-215ENST00000484528 C2orf27AQ580R0 203 aa22.86■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 SYT13Q7L8C5 426 aa22.86■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 ABCA7Q8IZY2 2146 aa22.86■■□□□ 1.25
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USP40-215ENST00000484528 SLC2A14Q8TDB8 520 aa22.86■■□□□ 1.25
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USP40-215ENST00000484528 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa22.86■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.86■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.86■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 GMIPQ9P107 970 aa22.86■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.86■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa22.85■■□□□ 1.25
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USP40-215ENST00000484528 VAMP7P51809 220 aa22.85■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 DHCR24Q15392 516 aa22.85■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.85■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa22.85■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 SFTPA1Q8IWL2 248 aa22.85■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 C12orf29Q8N999 325 aa22.85■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 ZMIZ2Q8NF64 920 aa22.85■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.85■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 SMOQ99835 787 aa22.85■■□□□ 1.25
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USP40-215ENST00000484528 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 AKAP3O75969 853 aa22.84■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 ADORA2BP29275 332 aa22.84■■□□□ 1.25
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USP40-215ENST00000484528 MAP3K7CLP57077 242 aa22.84■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 MESP2Q0VG99 397 aa22.84■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 HECTD3Q5T447 861 aa22.84■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 C12orf40Q86WS4 652 aa22.84■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.84■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 USP33Q8TEY7 942 aa22.84■■□□□ 1.25
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USP40-215ENST00000484528 IRF1P10914 325 aa22.83■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 PGFP49763 221 aa22.83■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 KDSRQ06136 332 aa22.83■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 PPP3CAQ08209 521 aa22.83■■□□□ 1.25
USP40-215ENST00000484528 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
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USP40-215ENST00000484528 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
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USP40-215ENST00000484528 NETO1Q8TDF5 533 aa22.83■■□□□ 1.25
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USP40-215ENST00000484528 A0A1W2PQD8 194 aa22.82■■□□□ 1.24
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USP40-215ENST00000484528 WBP2Q969T9 261 aa22.82■■□□□ 1.24
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USP40-215ENST00000484528 IMPG2Q9BZV3 1241 aa22.82■■□□□ 1.24
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USP40-215ENST00000484528 ZNF202O95125 648 aa22.81■■□□□ 1.24
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USP40-215ENST00000484528 ADH1CP00326 375 aa22.81■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 ADH5P11766 374 aa22.81■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 KRT13P13646 458 aa22.81■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 CD58P19256 250 aa22.81■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 DGKEP52429 567 aa22.81■■□□□ 1.24
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