RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476564.5

MTERF4-215, Transcript of mitochondrial transcription termination factor 4, human

TSL 2

Gene MTERF4, Length 614 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTERF4-215	ENST00000476564	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	DPYSL4	O14531	572 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	ABL1	P00519	1130 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	ABCB4	P21439	1286 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	GPR15	P49685	360 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	TKTL1	P51854	596 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	ARPP19	P56211	112 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	SLC6A3	Q01959	620 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	KIF5A	Q12840	1032 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	PLD1	Q13393	1074 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	LIN9	Q5TKA1	542 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	TRNP1	Q6NT89	227 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	BNIPL	Q7Z465	357 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	KIAA1328	Q86T90	577 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	NUP93	Q8N1F7	819 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	NT5C3B	Q969T7	300 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	CERS4	Q9HA82	394 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	PARVA	Q9NVD7	372 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	SCML2	Q9UQR0	700 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	KRT86	O43790	486 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	HSF2BP	O75031	334 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	DAB1	O75553	588 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	SOAT2	O75908	522 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	ZBED1	O96006	694 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	FYN	P06241	537 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	MAN1A1	P33908	653 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	GRIK1	P39086	918 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	EPHA5	P54756	1037 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	USP46	P62068	366 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	PTPRO	Q16827	1216 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	DDR2	Q16832	855 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	GPR153	Q6NV75	609 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	ZNF276	Q8N554	614 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	PSMG2	Q969U7	264 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	NUP85	Q9BW27	656 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	LRRC3	Q9BY71	257 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	TRIM7	Q9C029	511 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	SYNC	Q9H7C4	482 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	ST7	Q9NRC1	585 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	ASB3	Q9Y575	518 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564		E7ENQ6	273 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	PRRG1	O14668	218 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	TADA3	O75528	432 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	ZMYND10	O75800	440 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	GLP2R	O95838	553 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	IGLV3-25	P01717	112 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MTERF4-215	ENST00000476564	C8A	P07357	584 aa		10.81	□□□□□ -0.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 123.3 ms