RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 PIGFQ07326 219 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.345e-13■■■■■ 31.1
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RABGGTB-209ENST00000473406 WTAPQ15007 396 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 SEC23BQ15437 767 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 TBR1Q16650 682 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF484Q5JVG2 852 aa6.7□□□□□ -1.34
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RABGGTB-209ENST00000473406 SLC30A6Q6NXT4 461 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 MED25Q71SY5 747 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.7□□□□□ -1.34
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RABGGTB-209ENST00000473406 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.7□□□□□ -1.34
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RABGGTB-209ENST00000473406 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 SPARTQ8N0X7 666 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 PSD4Q8NDX1 1056 aa6.7□□□□□ -1.34
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RABGGTB-209ENST00000473406 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNG4Q8TDN1 519 aa6.7□□□□□ -1.34
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RABGGTB-209ENST00000473406 GPR20Q99678 358 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 FUZQ9BT04 418 aa6.7□□□□□ -1.34
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RABGGTB-209ENST00000473406 GIMAP2Q9UG22 337 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 VPS51Q9UID3 782 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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RABGGTB-209ENST00000473406 CDYLQ9Y232 598 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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RABGGTB-209ENST00000473406 CER1O95813 267 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 CLEC3BP05452 202 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 PORP16435 677 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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RABGGTB-209ENST00000473406 TAF11Q15544 211 aa6.69□□□□□ -1.34
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RABGGTB-209ENST00000473406 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.69□□□□□ -1.34
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RABGGTB-209ENST00000473406 RASGRP2Q7LDG7 609 aa6.69□□□□□ -1.34
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RABGGTB-209ENST00000473406 TMLHEQ9NVH6 421 aa6.69□□□□□ -1.34
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RABGGTB-209ENST00000473406 USP22Q9UPT9 525 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 RAD54BQ9Y620 910 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa6.68□□□□□ -1.34
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RABGGTB-209ENST00000473406 PTCHD3Q3KNS1 767 aa6.68□□□□□ -1.34
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RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD44Q8N8A2 993 aa6.68□□□□□ -1.34
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RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC191Q8NCU4 936 aa6.68□□□□□ -1.34
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RABGGTB-209ENST00000473406 BORCS6Q96GS4 357 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIB1Q96RU8 372 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 MECRQ9BV79 373 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-209ENST00000473406 ITPAQ9BY32 194 aa6.68□□□□□ -1.34
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