RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472218.1

RPS18-231, Transcript of ribosomal protein S18, human

TSL 2

Gene RPS18, Length 1,109 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS18-231	ENST00000472218	BDNF	P23560	247 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	NOS2	P35228	1153 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	AIF1	P55008	147 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	DAOA	P59103	153 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	OGDH	Q02218	1023 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	UBE3A	Q05086	875 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	ADIG	Q0VDE8	80 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	PSMD5	Q16401	504 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	RTP2	Q5QGT7	225 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	CEP57	Q86XR8	500 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	TEKT4	Q8WW24	435 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	ALG3	Q92685	438 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	BTBD6	Q96KE9	485 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	TRIM7	Q9C029	511 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	MYH10	P35580	1976 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	FAM92A	A1XBS5	289 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218		F8VP50	259 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	TNFRSF10B	O14763	440 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	CEP104	O60308	925 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	SRGAP2	O75044	1071 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	LRCH4	O75427	683 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	F9	P00740	461 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	UROD	P06132	367 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	RB1	P06400	928 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	LCP1	P13796	627 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	CPB1	P15086	417 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	GRIK1	P39086	918 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	PSEN1	P49768	467 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	RAB33A	Q14088	237 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	CCDC14	Q49A88	953 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	RTL10	Q7L3V2	364 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	BNIPL	Q7Z465	357 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	UBXN4	Q92575	508 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	KRT35	Q92764	455 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	SAMD11	Q96NU1	681 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	TMEM209	Q96SK2	561 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	SCML2	Q9UQR0	700 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	TSC2	P49815	1807 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	MTMR11	A4FU01	709 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	FSCN2	O14926	492 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	MDM4	O15151	490 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF185	O15231	689 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	ABLIM3	O94929	683 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	LTF	P02788	710 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	LINC00271	P0C7V0	271 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	CTSA	P10619	480 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	CYP2F1	P24903	491 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	CXCR5	P32302	372 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	FLT3	P36888	993 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	MTA1	Q13330	715 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	PDK2	Q15119	407 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	ODF2	Q5BJF6	829 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	MON1A	Q86VX9	555 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	NUP93	Q8N1F7	819 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF276	Q8N554	614 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	KCNK16	Q96T55	309 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	NPY6R	Q99463	290 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPS18-231	ENST00000472218	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		11.3	□□□□□ -0.6

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