RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471364.1

RUBCN-208, Transcript of RUN and cysteine rich domain containing beclin 1 interacting protein, human

TSL 3

Gene RUBCN, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUBCN-208	ENST00000471364	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	TAF3	Q5VWG9	929 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	TSSK4	Q6SA08	328 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	ARID3A	Q99856	593 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	BRD9	Q9H8M2	597 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	RAB23	Q9ULC3	237 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	USP18	Q9UMW8	372 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	COL4A2	P08572	1712 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF197	O14709	1029 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	SRGAP2	O75044	1071 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	ABLIM3	O94929	683 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	CXCL8	P10145	99 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	KRT5	P13647	590 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	CYP11B1	P15538	503 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	CEBPB	P17676	345 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	FMO1	Q01740	532 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	CDR2	Q01850	454 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	ROR1	Q01973	937 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	MTAP	Q13126	283 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	FZD5	Q13467	585 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	CUL2	Q13617	745 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	CORO1B	Q9BR76	489 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	RTKN	Q9BST9	563 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	IER2	Q9BTL4	223 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	ACP6	Q9NPH0	428 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	CACNA1B	Q00975	2339 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	LACTBL1	A8MY62	500 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364		H7C4K7	107 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364		I3L4J1	428 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	MICAL2	O94851	1124 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	TNNC2	P02585	160 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	MME	P08473	750 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	ATF2	P15336	505 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	PRLR	P16471	622 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	BRCC3	P46736	316 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	PDE6C	P51160	858 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	GRM2	Q14416	872 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	ELMOD1	Q8N336	334 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	UBR7	Q8N806	425 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	UBXN4	Q92575	508 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	IRF7	Q92985	503 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	ISCU	Q9H1K1	167 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	CHRD	Q9H2X0	955 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	SNX12	Q9UMY4	172 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	F5	P12259	2224 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	SCN1A	P35498	2009 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	WDR27	A2RRH5	827 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	ANKRD62	A6NC57	917 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	SYN3	O14994	580 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	RTN2	O75298	545 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	CALCA	P01258	141 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	FCAR	P24071	287 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RUBCN-208	ENST00000471364	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26

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