RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	CRB3	Q9BUF7	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	DKK3	Q9UBP4	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	MID2	Q9UJV3	735 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454		A1L4Q6	167 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	MGST3	O14880	152 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	RGS10	O43665	173 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	PLA2G6	O60733	806 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	PPFIA2	O75334	1257 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	RASAL1	O95294	804 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	EBLN1	P0CF75	366 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	MYL4	P12829	197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	TPH1	P17752	444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	LIPA	P38571	399 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	MTHFS	P49914	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	CCT8	P50990	548 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	CLCN2	P51788	898 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	BCAT1	P54687	386 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	TPTE	P56180	551 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	GRM1	Q13255	1194 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	STARD3	Q14849	445 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	GLG1	Q92896	1179 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	PPCS	Q9HAB8	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454		A0A087WV62	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454		H7C4K7	107 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	RAB27B	O00194	218 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	PSMD9	O00233	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	QSOX1	O00391	747 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	FFAR2	O15552	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	PIAS2	O75928	621 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	A1BG	P04217	495 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	PRKCB	P05771	671 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	FES	P07332	822 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	GPD1	P21695	349 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ADORA2A	P29274	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	EPHA3	P29320	983 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	PDE1A	P54750	535 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	NPY5R	Q15761	445 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF527	Q8NB42	609 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	LRRC46	Q96FV0	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	PROP1	O75360	226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	TJP3	O95049	919 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	IDE	P14735	1019 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	DRD4	P21917	467 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	PCSK6	P29122	969 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	COPA	P53621	1224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	SP2	Q02086	613 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ICA1	Q05084	483 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	TRIM14	Q14142	442 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ANO1	Q5XXA6	986 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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