RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 BCAT1P54687 386 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 HDAC4P56524 1084 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SLC6A3Q01959 620 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 BST2Q10589 180 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SNX1Q13596 522 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 DPYSL3Q14195 570 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SLC29A2Q14542 456 aa5.92□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 NOMO1Q15155 1222 aa5.92□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 ARTNQ5T4W7 220 aa5.92□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 FAM49BQ9NUQ9 324 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 FAM105AQ9NUU6 356 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 RNF19AQ9NV58 838 aa5.92□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 KLK14Q9P0G3 267 aa5.92□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa5.92□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 C9IYK1 514 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 HHLA1C9JL84 531 aa5.91□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 XPOTO43592 962 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 GFRA3O60609 400 aa5.91□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 TTC4O95801 387 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 C1QAP02745 245 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ASGR1P07306 291 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC130P13994 396 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ATF2P15336 505 aa5.91□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 GCAP28676 217 aa5.91□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 RASA2Q15283 850 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R7Q15435 360 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 DPYSL2Q16555 572 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CA9Q16790 459 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 RAB41Q5JT25 222 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 IZUMO3Q5VZ72 239 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF787Q6DD87 383 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CYP4F22Q6NT55 531 aa5.91□□□□□ -1.46
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