RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC105Q8IYK2 499 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
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RABGEF1-206ENST00000461017 PJA1Q8NG27 643 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 BPIFB1Q8TDL5 484 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXO32Q969P5 355 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 P2RY11Q96G91 374 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 SMARCD1Q96GM5 515 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
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RABGEF1-206ENST00000461017 CRACR2AQ9BSW2 395 aa7.42□□□□□ -1.22
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RABGEF1-206ENST00000461017 IMPG2Q9BZV3 1241 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 MFSD1Q9H3U5 465 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 CCSER2Q9H7U1 834 aa7.42□□□□□ -1.22
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RABGEF1-206ENST00000461017 TDP1Q9NUW8 608 aa7.42□□□□□ -1.22
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RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM63CQ9P1W3 806 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 NUDT5Q9UKK9 219 aa7.42□□□□□ -1.22
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RABGEF1-206ENST00000461017 BECN2A8MW95 431 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 MDM4O15151 490 aa7.41□□□□□ -1.22
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RABGEF1-206ENST00000461017 OLFM2O95897 454 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 ABL1P00519 1130 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM200BP0CF97 657 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 HDCP19113 662 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP7.41□□□□□ -1.22
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RABGEF1-206ENST00000461017 YWHAQP27348 245 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 KIF11P52732 1056 aa7.41□□□□□ -1.22
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RABGEF1-206ENST00000461017 UBXN2BQ14CS0 331 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 PKDCCQ504Y2 493 aa7.41□□□□□ -1.22
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RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGAP17Q68EM7 881 aa7.41□□□□□ -1.22
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RABGEF1-206ENST00000461017 TTC16Q8NEE8 873 aa7.41□□□□□ -1.22
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RABGEF1-206ENST00000461017 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 CPQQ9Y646 472 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 WNT6Q9Y6F9 365 aa7.41□□□□□ -1.22
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RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC192P0DO97 292 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 CHRNB1P11230 501 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 TCF3P15923 654 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 BRD2P25440 801 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 PON1P27169 355 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 AVPR1AP37288 418 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 KLK7P49862 253 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF132P52740 706 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC7A9P82251 487 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
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