RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 DCLK1O15075 740 aa4.51□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 CCL16O15467 120 aa4.51□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 GSNP06396 782 aa4.51□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 POU2F2P09086 479 aa4.51□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 POLR2MP0CAP2 368 aa4.51□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 GOLGA8HP0CJ92 632 aa4.51□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 RPL17P18621 184 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
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ECHDC1-211ENST00000460558 DPP6P42658 865 aa4.51□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
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ECHDC1-211ENST00000460558 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
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ECHDC1-211ENST00000460558 MBOAT7Q96N66 472 aa4.51□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 MCMBPQ9BTE3 642 aa4.51□□□□□ -1.69
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ECHDC1-211ENST00000460558 TOMM22Q9NS69 142 aa4.51□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 CHST7Q9NS84 486 aa4.51□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 FBXW11Q9UKB1 542 aa4.51□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 ST14Q9Y5Y6 855 aa4.51□□□□□ -1.69
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ECHDC1-211ENST00000460558 COL1A2P08123 1366 aa4.51□□□□□ -1.69
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ECHDC1-211ENST00000460558 SHISA3A0PJX4 238 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC38A8A6NNN8 435 aa4.5□□□□□ -1.69
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ECHDC1-211ENST00000460558 E9PAM4 449 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 H0Y8X5 98 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 ARNTLO00327 626 aa4.5□□□□□ -1.69
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ECHDC1-211ENST00000460558 FAM87AP0C7U9 286 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 KCNA2P16389 499 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 ATP5JP18859 108 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 FCARP24071 287 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 ADSSP30520 456 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 IGFALSP35858 605 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC26A2P50443 739 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 RAB27AP51159 221 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 STAT5BP51692 787 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 CXADRP78310 365 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 NFKB2Q00653 900 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 POU4F1Q01851 419 aa4.5□□□□□ -1.69
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ECHDC1-211ENST00000460558 TRAF1Q13077 416 aa4.5□□□□□ -1.69
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ECHDC1-211ENST00000460558 PON2Q15165 354 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 PRSS53Q2L4Q9 553 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 USP41Q3LFD5 358 aa4.5□□□□□ -1.69
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ECHDC1-211ENST00000460558 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM78AQ5JUQ0 283 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC23A3Q6PIS1 610 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 VITQ6UXI7 678 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 TAS1R1Q7RTX1 841 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 SYT12Q8IV01 421 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 YAF2Q8IY57 180 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 AHI1Q8N157 1196 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 METTL13Q8N6R0 699 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGAP45Q92619 1136 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 LPPQ93052 612 aa4.5□□□□□ -1.69
ECHDC1-211ENST00000460558 TTC14Q96N46 770 aa4.5□□□□□ -1.69
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