RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 ECT2Q9H8V3 914 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 POLD4Q9HCU8 107 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 RXFP3Q9NSD7 469 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 GTSE1Q9NYZ3 720 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 CEP250Q9BV73 2442 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 FRMD3A2A2Y4 597 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 PROS1P07225 676 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 PLCG1P19174 1290 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 MPLP40238 635 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 TNFRSF4P43489 277 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 DGKEP52429 567 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 SLC7A9P82251 487 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 LMAN2Q12907 356 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 SEZ6Q53EL9 994 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 WDR44Q5JSH3 913 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 WSCD1Q658N2 575 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 LEKR1Q6ZMV7 388 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 SV2BQ7L1I2 683 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM150AQ86TG1 271 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 ATL2Q8NHH9 583 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 C8orf48Q96LL4 319 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 GCNT4Q9P109 453 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 TBC1D14Q9P2M4 693 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 ATP8B3O60423 1300 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 KCNK5O95279 499 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 CEACAM1P13688 526 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 WARSP23381 471 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 ANXA13P27216 316 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 GJA4P35212 333 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 PEX19P40855 299 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 SYKP43405 635 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 SOX9P48436 509 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 GALK1P51570 392 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 NOP14P78316 857 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 CYP4F8P98187 520 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 IQCB1Q15051 598 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 EML3Q32P44 896 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 MAP9Q49MG5 647 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 STXBP5Q5T5C0 1151 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 Q6ZS52 159 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 KBTBD6Q86V97 674 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 CEP76Q8TAP6 659 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 MAGEF1Q9HAY2 307 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 COMMD10Q9Y6G5 202 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 MYMKA6NI61 221 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 ANKRD63C9JTQ0 380 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 PPEF2O14830 753 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 TACC1O75410 805 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 TNNC2P02585 160 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 AP3M2P53677 418 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 KCNA1Q09470 495 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 DMC1Q14565 340 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 MCM6Q14566 821 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 EOGTQ5NDL2 527 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 PMS2CLQ68D20 193 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 RNF43Q68DV7 783 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 SARM1Q6SZW1 724 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 LRRC31Q6UY01 552 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 MAB21L3Q8N8X9 362 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 OLIG1Q8TAK6 271 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 SPACA7Q96KW9 195 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 CARD6Q9BX69 1037 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 MMP17Q9ULZ9 603 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 H0Y626 953 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 TNFRSF10BO14763 440 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 RNF40O75150 1001 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms