RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429422.5

MAP4-208, Transcript of microtubule associated protein 4, human

TSL 1 (best)

Gene MAP4, Length 3,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MAP4-208	ENST00000429422	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	BBOF1	Q8ND07	529 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	KAT2B	Q92831	832 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	SERPINB12	Q96P63	405 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	SIK2	Q9H0K1	926 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	RBP3	P10745	1247 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	MSH2	P43246	934 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	SPRYD7	Q5W111	196 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	CROCCP2	Q86T23	111 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	FBF1	Q8TES7	1133 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	KRT7	P08729	469 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	ARL4A	P40617	200 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	MAGEA4	P43358	317 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	PSEN1	P49768	467 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	GAD2	Q05329	585 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	KYAT1	Q16773	422 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	CENPU	Q71F23	418 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	SPATA18	Q8TC71	538 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	NACA2	Q9H009	215 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	USP18	Q9UMW8	372 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	C5orf60	A6NFR6	353 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	HCRT	O43612	131 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	APRT	P07741	180 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	DRD4	P21917	467 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	NRL	P54845	237 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	ITK	Q08881	620 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	ZBTB6	Q15916	424 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	CCDC142	Q17RM4	750 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	PMF1	Q6P1K2	205 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	HASPIN	Q8TF76	798 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	MPP2	Q14168	576 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	VSTM1	Q6UX27	236 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	TTC30A	Q86WT1	665 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	AGAP3	Q96P47	875 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	EURL	Q9NYK6	297 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	TCEA3	O75764	348 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	GABBR2	O75899	941 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	PHB	P35232	272 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	MMRN1	Q13201	1228 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	BBS12	Q6ZW61	710 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	PPM1N	Q8N819	430 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	NETO2	Q8NC67	525 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	SNX27	Q96L92	541 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	BANF1	O75531	89 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	F2	P00734	622 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	GCA	P28676	217 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	PKDCC	Q504Y2	493 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MAP4-208	ENST00000429422	RSPH3	Q86UC2	560 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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