RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428426.2

AC002511.1-201, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AC002511.1, Length 1,000 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC002511.1-201ENST00000428426 ZNF233A6NK53 670 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 TAF4O00268 1085 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 TRIM66O15016 1216 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 ADH5P11766 374 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 HOXD13P35453 343 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 GRIA2P42262 883 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 PGFP49763 221 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 LMAN2Q12907 356 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 SEMA3BQ13214 749 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 DUOXA2Q1HG44 320 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 LYSMD4Q5XG99 296 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 SLC23A3Q6PIS1 610 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 BRAPQ7Z569 592 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 PIP4P1Q86T03 277 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 TMEM25Q86YD3 366 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 BBS7Q8IWZ6 715 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 PDILTQ8N807 584 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 SCAMP5Q8TAC9 235 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 SPACA7Q96KW9 195 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 C8orf48Q96LL4 319 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 KCNK16Q96T55 309 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 ACOX2Q99424 681 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 CEP295Q9C0D2 2601 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 SNX25Q9H3E2 840 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 SLC32A1Q9H598 525 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 OLFML3Q9NRN5 406 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 PCDH15Q96QU1 1955 aa11.39□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 ASPMQ8IZT6 3477 aa11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 FRMD3A2A2Y4 597 aa11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 CLIC2O15247 247 aa11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 COCHO43405 550 aa11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 TULP3O75386 442 aa11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 DLATP10515 647 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 IRF1P10914 325 aa11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 PFKLP17858 780 aa11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 GABRG2P18507 467 aa11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 YWHAQP27348 245 aa11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 TNFRSF4P43489 277 aa11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 PDE6CP51160 858 aa11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 CDH8P55286 799 aa11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 NOP14P78316 857 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 LRSAM1Q6UWE0 723 aa11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 ZNF516Q92618 1163 aa11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 TRIM9Q9C026 710 aa11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 SLC6A17Q9H1V8 727 aa11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 CCSER2Q9H7U1 834 aa11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 HSPBP1Q9NZL4 362 aa11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 SLC6A14Q9UN76 642 aa11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 LHX6Q9UPM6 363 aa11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 MSRB2Q9Y3D2 182 aa11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 ADAMTS20P59510 1910 aa11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 AKAP13Q12802 2813 aa11.38□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 A8MXQ7 604 aa11.37□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 ADH1CP00326 375 aa11.37□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 CD59P13987 128 aa11.37□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 TNNI1P19237 187 aa11.37□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 MAOBP27338 520 aa11.37□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 STAT6P42226 847 aa11.37□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 PPP3CCP48454 512 aa11.37□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 GAD2Q05329 585 aa11.37□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 ZNF33AQ06730 810 aa11.37□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 DUOXA1Q1HG43 343 aa11.37□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 ANO4Q32M45 955 aa11.37□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 WDR72Q3MJ13 1102 aa11.37□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa11.37□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 PAQR9Q6ZVX9 377 aa11.37□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa11.37□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 NUP93Q8N1F7 819 aa11.37□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 PNPLA1Q8N8W4 532 aa11.37□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 FBXO32Q969P5 355 aa11.37□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 CCDC127Q96BQ5 260 aa11.37□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 SLITRK1Q96PX8 696 aa11.37□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa11.37□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa11.37□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 RAD54BQ9Y620 910 aa11.37□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 ATRXP46100 2492 aa11.37□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa11.36□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 A0A1W2PQF6 199 aa11.36□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 E2F8A0AVK6 867 aa11.36□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 TMEM8BA6NDV4 472 aa11.36□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 WASH3PC4AMC7 463 aa11.36□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 TGFB1I1O43294 461 aa11.36□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 SH3BP5O60239 455 aa11.36□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 OPHN1O60890 802 aa11.36□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 TACC1O75410 805 aa11.36□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
AC002511.1-201ENST00000428426 CASP4P49662 377 aa11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms