RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 PIGZQ86VD9 579 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 TLDC2A0PJX2 215 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 I3L4J1 428 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 RABGGTBP53611 331 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 GDF10P55107 478 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 NPNTQ6UXI9 565 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 RNF180Q86T96 592 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 ADAM2Q99965 735 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 ADAM7Q9H2U9 754 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 GIT1Q9Y2X7 761 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 DPYSL4O14531 572 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 CAND2O75155 1236 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 ITGAVP06756 1048 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 HDAC4P56524 1084 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 DPYSL3Q14195 570 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 CAPS2Q9BXY5 557 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 GABRDO14764 452 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 ADIGQ0VDE8 80 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 KRT81Q14533 505 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 CA9Q16790 459 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 DSTYKQ6XUX3 929 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 PAQR9Q6ZVX9 377 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 RAET1EQ8TD07 263 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 MED10Q9BTT4 135 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 RSAD1Q9HA92 442 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 SLCO1A2P46721 670 aa24.25■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 CAV1Q03135 178 aa24.25■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 FAM182AQ5T1J6 154 aa24.25■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa24.25■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 SLC26A9Q7LBE3 791 aa24.25■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 DNAI2Q9GZS0 605 aa24.25■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 CRTAC1Q9NQ79 661 aa24.25■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 KDM7AQ6ZMT4 941 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 HASPINQ8TF76 798 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 DUSP16Q9BY84 665 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 APOC2P02655 101 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 RPL34P49207 117 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 PTK7Q13308 1070 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 KYNUQ16719 465 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 TRPV6Q9H1D0 765 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 ENDOD1O94919 500 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 NPR3P17342 541 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 NDUFV1P49821 464 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 NRLP54845 237 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 GNGT1P63211 74 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 TTC13Q8NBP0 860 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 BBOF1Q8ND07 529 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 SPATA18Q8TC71 538 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 FAM149B1Q96BN6 582 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 HSFY1Q96LI6 401 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 MAGEB5Q9BZ81 275 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 RABEP2Q9H5N1 569 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 CREBZFQ9NS37 354 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 KRT82Q9NSB4 513 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 A0A0U1RQF3 1178 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 TOMM70O94826 608 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 ACTN2P35609 894 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 MAP3K7CLP57077 242 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 SKOR1P84550 965 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 DSC3Q14574 896 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 UPP1Q16831 310 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 CLEC20AQ6ZU45 233 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 HOOK3Q86VS8 718 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 CCHCR1Q8TD31 782 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 MYBPHLA2RUH7 354 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 IL4RP24394 825 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 ACADSBP45954 432 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 SLC8A3P57103 927 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 GUCY1A3Q02108 690 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 TIGD5Q53EQ6 642 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 BOLA3Q53S33 107 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 C1orf228Q6PIY5 440 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 LEKR1Q6ZMV7 388 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 UNC45BQ8IWX7 931 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 SYT15Q9BQS2 421 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-209ENST00000428120 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms