RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 URGCPQ8TCY9 931 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 SCFD2Q8WU76 684 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 TAAR1Q96RJ0 339 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 CNGB3Q9NQW8 809 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 SYBUQ9NX95 663 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 DAPK2Q9UIK4 370 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 RASSF9O75901 435 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 GSNP06396 782 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 CHRM3P20309 590 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 ATP6V1B2P21281 511 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 MAPK11Q15759 364 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 OR8H2Q8N162 312 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 EVPLLA8MZ36 301 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 GALNTL6Q49A17 601 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 SEZ6Q53EL9 994 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 FAM136AQ96C01 138 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 MED15Q96RN5 788 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 SEMA6BQ9H3T3 888 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 TBC1D12O60347 775 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 RHOBTB1O94844 696 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 CBX6O95503 412 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 MT-CO1P00395 513 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 PGK2P07205 417 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 NPEPPSP55786 919 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 POU4F1Q01851 419 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 GRB10Q13322 594 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 SYTL3Q4VX76 610 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 BBS7Q8IWZ6 715 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 GDPD5Q8WTR4 605 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 MTMR8Q96EF0 704 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 RUSC1Q9BVN2 902 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 ROGDIQ9GZN7 287 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 A0A1B0GW55 424 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 DUX4L2P0CJ85 424 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 DUX4L3P0CJ86 424 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 DUX4L4P0CJ87 422 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 DUX4L5P0CJ88 424 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 DUX4L6P0CJ89 424 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 DUX4L7P0CJ90 424 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 GRK2P25098 689 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 SLC34A1Q06495 639 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 EMC2Q15006 297 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 XKR3Q5GH77 459 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 DACT2Q5SW24 774 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 ELMOD1Q8N336 334 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 DUX4Q9UBX2 424 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 PMPCBO75439 489 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 FAM58BPP0C7Q3 252 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 TTI2Q6NXR4 508 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 FAM117BQ6P1L5 589 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 H0YC42 278 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 RPA1P27694 616 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF844Q08AG5 666 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 FAM83EQ2M2I3 478 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 TRIM69Q86WT6 500 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 CALML6Q8TD86 181 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 TIPINQ9BVW5 301 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 CHST12Q9NRB3 414 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 NR5A2O00482 541 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 AP1G2O75843 785 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 UPP2O95045 317 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 MIEF2Q96C03 454 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 DCDC2Q9UHG0 476 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 HPSEQ9Y251 543 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 TBX3O15119 743 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 PSTPIP1O43586 416 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 FKBP6O75344 327 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 MMRN1Q13201 1228 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 RNF148Q8N7C7 305 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 COQ7Q99807 217 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 MRGBPQ9NV56 204 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 ARMCX1Q9P291 453 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 RIPK2O43353 540 aa14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms