RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PMS1-205ENST00000409985 DYNLT1P63172 113 aa24.83■■□□□ 1.57
PMS1-205ENST00000409985 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
PMS1-205ENST00000409985 DPYSL3Q14195 570 aa24.83■■□□□ 1.57
PMS1-205ENST00000409985 ASRGL1Q7L266 308 aa24.83■■□□□ 1.57
PMS1-205ENST00000409985 CCDC91Q7Z6B0 441 aa24.83■■□□□ 1.57
PMS1-205ENST00000409985 EMC1Q8N766 993 aa24.83■■□□□ 1.57
PMS1-205ENST00000409985 TEKT4Q8WW24 435 aa24.83■■□□□ 1.57
PMS1-205ENST00000409985 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
PMS1-205ENST00000409985 FLRT1Q9NZU1 646 aa24.83■■□□□ 1.57
PMS1-205ENST00000409985 DERAQ9Y315 318 aa24.83■■□□□ 1.57
PMS1-205ENST00000409985 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 CFAP69A5D8W1 941 aa24.83■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 EDF1O60869 148 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 FAM155BO75949 473 aa24.83■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 ALADP13716 330 aa24.83■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 CA4P22748 312 aa24.83■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 SNX16P57768 344 aa24.83■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 BOLA3Q53S33 107 aa24.83■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 FNBP1LQ5T0N5 605 aa24.83■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 C4orf22Q6V702 233 aa24.83■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa24.83■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 FAM228AQ86W67 206 aa24.83■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 UNC45BQ8IWX7 931 aa24.83■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 LRRC8CQ8TDW0 803 aa24.83■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 COPS5Q92905 334 aa24.83■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 RTP4Q96DX8 246 aa24.83■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 PHTF1Q9UMS5 762 aa24.83■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 CHADO15335 359 aa24.82■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 LGALS2P05162 132 aa24.82■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 ALDH3A1P30838 453 aa24.82■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 FCGRTP55899 365 aa24.82■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 MAP2K5Q13163 448 aa24.82■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 CCL14Q16627 93 aa24.82■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD22Q5VYY1 191 aa24.82■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 PALM2Q8IXS6 379 aa24.82■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 SPATA18Q8TC71 538 aa24.82■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 FBF1Q8TES7 1133 aa24.82■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 TBCBQ99426 244 aa24.82■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 BEGAINQ9BUH8 593 aa24.82■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 VTA1Q9NP79 307 aa24.82■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 HMGXB4Q9UGU5 601 aa24.82■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 A0A087WZ62 844 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 SPAG7O75391 227 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 CAPN15O75808 1086 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 DCTN3O75935 186 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 CD48P09326 243 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 ROR1Q01973 937 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 PRKCZQ05513 592 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 HHATQ5VTY9 493 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 ECHDC2Q86YB7 292 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 FBXO36Q8NEA4 188 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 PPTC7Q8NI37 304 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 MZB1Q8WU39 189 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 CYTH2Q99418 400 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 NT5C1AQ9BXI3 368 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 PNPLA8Q9NP80 782 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 PCSK1NQ9UHG2 260 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 FKTNO75072 461 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 TGM2P21980 687 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 MSH2P43246 934 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 SETDB1Q15047 1291 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 MSS51Q4VC12 460 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 ANKMY2Q8IV38 441 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 KLHL29Q96CT2 875 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 MAML3Q96JK9 1138 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 ACAP3Q96P50 834 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 PAFAH2Q99487 392 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 VPS11Q9H270 941 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 NOD2Q9HC29 1040 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 CD248Q9HCU0 757 aa24.81■■□□□ 1.56
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PMS1-205ENST00000409985 DPP3Q9NY33 737 aa24.81■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa24.8■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 IGHA2P01877 340 aa24.8■■□□□ 1.56
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PMS1-205ENST00000409985 MGAT5Q09328 741 aa24.8■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
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PMS1-205ENST00000409985 DPP9Q86TI2 863 aa24.8■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 STK32AQ8WU08 396 aa24.8■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 HSPH1Q92598 858 aa24.8■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 RMDN2Q96LZ7 410 aa24.8■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 RNF157Q96PX1 679 aa24.8■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 PAK5Q9P286 719 aa24.8■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 PRPSAP2O60256 369 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 TMEM63AO94886 807 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 UNC5CO95185 931 aa24.79■■□□□ 1.56
PMS1-205ENST00000409985 PDGFRAP16234 1089 aa24.79■■□□□ 1.56
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