RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393389.7

ANKRD42-202, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 4,066 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-202ENST00000393389 TTC7BQ86TV6 843 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC26A11Q86WA9 606 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 OR6P1Q8NGX9 317 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF516Q92618 1163 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 HERPUD2Q9BSE4 406 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 BATF3Q9NR55 127 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 WDR35Q9P2L0 1181 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 MYH11P35749 1972 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 F7P08709 466 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 CALB2P22676 271 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 MLH1P40692 756 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 GDF10P55107 478 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 PCSK7Q16549 785 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC30A9Q6PML9 568 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 SCN4BQ8IWT1 228 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 STK32AQ8WU08 396 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 PYDC1Q8WXC3 89 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 TASP1Q9H6P5 420 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 DCLRE1BQ9H816 532 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 NUP188Q5SRE5 1749 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 M0QZ92 97 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 CTSHP09668 335 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 NCKAP1LP55160 1127 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 MCL1Q07820 350 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 PRPSAP1Q14558 356 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM132BQ14DG7 1078 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 PTPN20Q4JDL3 420 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 FNBP1LQ5T0N5 605 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 JADE1Q6IE81 842 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 KRT80Q6KB66 452 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 MPZL3Q6UWV2 235 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 C4orf50Q6ZRC1 276 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 ALLCQ8N6M5 410 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM13CQ8NE31 585 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC7A14Q8TBB6 771 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 TFAP2BQ92481 460 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM176AQ96HP8 235 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 GPR88Q9GZN0 384 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 IL1RL2Q9HB29 575 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 ARL8BQ9NVJ2 186 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC24A2Q9UI40 661 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 A0A0B4J269 797 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 WDR27A2RRH5 827 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 LACTBL1A8MY62 500 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 PFDN1O60925 122 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 DNAJC6O75061 913 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 MICAL2O94851 1124 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 GNAT1P11488 350 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 AKAP5P24588 427 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 STIP1P31948 543 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 AP3M2P53677 418 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 PRAMEP78395 509 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 ITGA9Q13797 1035 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 IFNEQ86WN2 208 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 BEST2Q8NFU1 509 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 B3GNT5Q9BYG0 378 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 MAN1C1Q9NR34 630 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 DPP3Q9NY33 737 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 GGA2Q9UJY4 613 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 MYH3P11055 1940 aa8.99□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 LRP6O75581 1613 aa8.99□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 TPST1O60507 370 aa8.99□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 FDX1P10109 184 aa8.99□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC25A3Q00325 362 aa8.99□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 PDK4Q16654 411 aa8.99□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 EFHC2Q5JST6 749 aa8.99□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.99□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 BRSK2Q8IWQ3 736 aa8.99□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 SCUBE1Q8IWY4 988 aa8.99□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM130Q8N3G9 435 aa8.99□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 ICA1LQ8NDH6 482 aa8.99□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 AGBL3Q8NEM8 1001 aa8.99□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 CLEC4DQ8WXI8 215 aa8.99□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 MFSD14AQ96MC6 490 aa8.99□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 CPXM1Q96SM3 734 aa8.99□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 TRPV6Q9H1D0 765 aa8.99□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 PORCNQ9H237 461 aa8.99□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 YY1AP1Q9H869 796 aa8.99□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ANKRD42-202ENST00000393389 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.2 ms