RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384545.1

RNU6-441P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 441, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-441P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-441P-201ENST00000384545 KRT32Q14532 448 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 METTL24Q5JXM2 366 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 TSHZ3Q63HK5 1081 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 ATG16L1Q676U5 607 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 HAUS3Q68CZ6 603 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 FAM9BQ8IZU0 186 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 POU5F2Q8N7G0 328 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 USP38Q8NB14 1042 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 TMEM176AQ96HP8 235 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 AGXT2Q9BYV1 514 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 SMOC2Q9H3U7 446 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 CXorf36Q9H7Y0 433 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 KCND3Q9UK17 655 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 TBX20Q9UMR3 447 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 NFU1Q9UMS0 254 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 TTLL3Q9Y4R7 772 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 FSD2A1L4K1 749 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 E7ENX8 843 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 RFXAPO00287 272 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 DHHO43323 396 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 LMNAP02545 664 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 HLA-DOAP06340 250 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 INHBBP09529 407 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 HGFP14210 728 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 GLDCP23378 1020 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 RPS6KB1P23443 525 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 RPS19P39019 145 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 GATMP50440 423 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 CDK7P50613 346 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 PGDP52209 483 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 TAP2Q03519 686 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 GRM7Q14831 915 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 CTXN3Q4LDR2 81 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 FBLN7Q53RD9 439 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 SP8Q8IXZ3 490 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 SLC15A3Q8IY34 581 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 MDGA1Q8NFP4 955 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 HMGB4Q8WW32 186 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 SDF4Q9BRK5 362 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 RNPEPQ9H4A4 650 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 SEC61A2Q9H9S3 476 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 FSCN3Q9NQT6 498 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 NEU2Q9Y3R4 380 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 PGPEP1LA6NFU8 196 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 KIF28PB7ZC32 967 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 USO1O60763 962 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 TMCC2O75069 709 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 RPP40O75818 363 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 LARGE1O95461 756 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 CER1O95813 267 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 KCNA2P16389 499 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 YY1P25490 414 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 PPIFP30405 207 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 NTSR1P30989 418 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 UQCRC1P31930 480 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 ADAM17P78536 824 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 GALNTL6Q49A17 601 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 ZNF385BQ569K4 471 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 ZNF569Q5MCW4 686 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 CERCAMQ5T4B2 595 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 ARHGAP40Q5TG30 622 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 FOXR2Q6PJQ5 311 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 TRABD2AQ86V40 505 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 RHOT2Q8IXI1 618 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 OR8H2Q8N162 312 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 ANKRD52Q8NB46 1076 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 ADAMTS15Q8TE58 950 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 TMEM171Q8WVE6 324 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 TIGD1Q96MW7 591 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 LRRC37BQ96QE4 947 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-441P-201ENST00000384545 LMF1Q96S06 567 aa4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms