RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368020.5

USF1-202, Transcript of upstream transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USF1, Length 1,717 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1-202ENST00000368020 SLCO1A2P46721 670 aa14.66□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 SEC24CP53992 1094 aa14.66□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 BCAT1P54687 386 aa14.66□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 SLC6A3Q01959 620 aa14.66□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 SNX17Q15036 470 aa14.66□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 LONRF1Q17RB8 773 aa14.66□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 SMTNL2Q2TAL5 461 aa14.66□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 SV2CQ496J9 727 aa14.66□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 XKR4Q5GH76 650 aa14.66□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa14.66□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.66□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 UBA3Q8TBC4 463 aa14.66□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 PPM1EQ8WY54 764 aa14.66□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 FAM118BQ9BPY3 351 aa14.66□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 TMEM121Q9BTD3 319 aa14.66□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 RNF208Q9H0X6 261 aa14.66□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 TJP2Q9UDY2 1190 aa14.66□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 GINS2Q9Y248 185 aa14.66□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 TGM2P21980 687 aa14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 MAGEA9P43362 315 aa14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 ARL4CP56559 192 aa14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 BST2Q10589 180 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 HIF1AQ16665 826 aa14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 TAF2Q6P1X5 1199 aa14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 OLFML1Q6UWY5 402 aa14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 C4orf22Q6V702 233 aa14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 DPH6Q7L8W6 267 aa14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 CRYBG2Q8N1P7 616 aa14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 ANKS4BQ8N8V4 417 aa14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 SLC35F5Q8WV83 523 aa14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 RXFP2Q8WXD0 754 aa14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 HSPH1Q92598 858 aa14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 TNIP3Q96KP6 325 aa14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 CALN1Q9BXU9 219 aa14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 SAYSD1Q9NPB0 183 aa14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 OGDHLQ9ULD0 1010 aa14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
USF1-202ENST00000368020 PIRO00625 290 aa14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 MDM4O15151 490 aa14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 ALOX15BO15296 676 aa14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 IFNB1P01574 187 aa14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 PFKMP08237 780 aa14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 PTPN9P43378 593 aa14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 TAF6P49848 677 aa14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 ACLYP53396 1101 aa14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 CDH6P55285 790 aa14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 SLC8A3P57103 927 aa14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 MTFR1Q15390 333 aa14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 KCNT1Q5JUK3 1230 aa14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 HACE1Q8IYU2 909 aa14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 OTUD6BQ8N6M0 293 aa14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 ANKRD52Q8NB46 1076 aa14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 OR6B3Q8NGW1 331 aa14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 HAUS1Q96CS2 278 aa14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 SNX25Q9H3E2 840 aa14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 PCSK1NQ9UHG2 260 aa14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa14.63□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 A8MXQ7 604 aa14.63□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 KPNA7A9QM74 516 aa14.63□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 DNM1LO00429 736 aa14.63□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 DYNLT1P63172 113 aa14.63□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 ROR1Q01973 937 aa14.63□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 TMEM62Q0P6H9 643 aa14.63□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 KRT81Q14533 505 aa14.63□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 NOMO1Q15155 1222 aa14.63□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 CCDC142Q17RM4 750 aa14.63□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa14.63□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 ACOT1Q86TX2 421 aa14.63□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 C7orf31Q8N865 590 aa14.63□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 APPL2Q8NEU8 664 aa14.63□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 SPATA18Q8TC71 538 aa14.63□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 DNAJB3Q8WWF6 145 aa14.63□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 HSFY1Q96LI6 401 aa14.63□□□□□ -0.07
USF1-202ENST00000368020 DEFB118Q96PH6 123 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms