RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356924.8

ABCD4-201, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ABCD4, Length 3,003 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-201ENST00000356924 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa11.63□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 GLB1LQ6UWU2 654 aa11.63□□□□□ -0.55
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ABCD4-201ENST00000356924 COLGALT2Q8IYK4 626 aa11.63□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 SH2D3CQ8N5H7 860 aa11.63□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 TET1Q8NFU7 2136 aa11.63□□□□□ -0.55
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ABCD4-201ENST00000356924 RXFP2Q8WXD0 754 aa11.63□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 RSPH1Q8WYR4 309 aa11.63□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 DUSP16Q9BY84 665 aa11.63□□□□□ -0.55
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ABCD4-201ENST00000356924 MYBPHLA2RUH7 354 aa11.63□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
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ABCD4-201ENST00000356924 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
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ABCD4-201ENST00000356924 GUCY2DQ02846 1103 aa11.63□□□□□ -0.55
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ABCD4-201ENST00000356924 TRADDQ15628 312 aa11.63□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 RAB6CQ53S08 254 aa11.63□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 CYB5D1Q6P9G0 228 aa11.63□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 KDM7AQ6ZMT4 941 aa11.63□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 NLRP14Q86W24 1093 aa11.63□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
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ABCD4-201ENST00000356924 SPATA18Q8TC71 538 aa11.63□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 RAB6CQ9H0N0 254 aa11.63□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
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ABCD4-201ENST00000356924 CDH9Q9ULB4 789 aa11.63□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 DPYSL4O14531 572 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 TTI1O43156 1089 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 GRAP2O75791 330 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 PAX3P23760 479 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 PLCB3Q01970 1234 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 E2F5Q15329 346 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 RCOR2Q8IZ40 523 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 SCLYQ96I15 445 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 ZNF333Q96JL9 665 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 SUSD3Q96L08 255 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 HSFY1Q96LI6 401 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 SLITRK1Q96PX8 696 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 PLVAPQ9BX97 442 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 NLRC5Q86WI3 1866 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 ESYT3A0FGR9 886 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 PI4K2BG5E9Z4 385 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 CAPN15O75808 1086 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 FAM107AO95990 144 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 KRT1P04264 644 aa11.62□□□□□ -0.55
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ABCD4-201ENST00000356924 COL6A1P12109 1028 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 CARSP49589 748 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 ACAP1Q15027 740 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 PPP2R5EQ16537 467 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 TRIM60Q495X7 471 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 CCDC14Q49A88 953 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 CLEC20AQ6ZU45 233 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 PIGZQ86VD9 579 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 IFT20Q8IY31 132 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 CCDC26Q8TAB7 109 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 URGCPQ8TCY9 931 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 RAPGEF5Q92565 580 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 SEPT8Q92599 483 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 PKMYT1Q99640 499 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 CXCL10P02778 98 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 LCP1P13796 627 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 NPR3P17342 541 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 CHRNA3P32297 505 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 ACADSBP45954 432 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 MFSD7Q6UXD7 560 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 POLNQ7Z5Q5 900 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 CRIPAKQ8N1N5 446 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 PCED1BQ96HM7 432 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 PEBP4Q96S96 227 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 CNPY3Q9BT09 278 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 MED10Q9BTT4 135 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 OSBPL8Q9BZF1 889 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 PCYOX1Q9UHG3 505 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 MTUS1Q9ULD2 1270 aa11.62□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
ABCD4-201ENST00000356924 E7EVH7 732 aa11.61□□□□□ -0.55
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