RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 TMC3Q7Z5M5 1100 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 DLG5Q8TDM6 1919 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM220BPB1ANY3 271 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 OPLAHO14841 1288 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 TBX3O15119 743 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 MSH3P20585 1137 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SULF1Q8IWU6 871 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC20A1Q8WUM9 679 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 WNK4Q96J92 1243 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ERGIC2Q96RQ1 377 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 EFCAB6Q5THR3 1501 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 GCP02774 474 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF12P17014 697 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SCNN1DP51172 638 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 RPS8P62241 208 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ENPEPQ07075 957 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 HECTD3Q5T447 861 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 CAMK1DQ8IU85 385 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 AHI1Q8N157 1196 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF333Q96JL9 665 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 FLT1P17948 1338 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC166P0CW27 439 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 S100GP29377 79 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 PIK3CGP48736 1102 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 GALNT18Q6P9A2 607 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 BTN2A2Q8WVV5 523 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 BHMTQ93088 406 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 PGBD4Q96DM1 585 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 METTL21EPA6NDL7 271 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 CSPG5O95196 566 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 PSMG1O95456 288 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 GALCP54803 685 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 FBXO42Q6P3S6 717 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 BORCS5Q969J3 196 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ADAM33Q9BZ11 813 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 FCER1AP12319 257 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 C17orf75Q9HAS0 396 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SPIRE1Q08AE8 756 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 C11orf63Q6NUN7 778 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 CD302Q8IX05 232 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 OXER1Q8TDS5 423 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 TATDN2Q93075 761 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 AGPAT1Q99943 283 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 KIFC1Q9BW19 673 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 RIBC2Q9H4K1 309 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SHOC2Q9UQ13 582 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP6V1G1O75348 118 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 CYP2C8P10632 490 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 GSCP56915 257 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 TGM3Q08188 693 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 GTF2H3Q13889 308 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 UBE2SQ16763 222 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 TXNRD1Q16881 649 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SPDYAQ5MJ70 313 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SYDE2Q5VT97 1194 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 KCNB2Q92953 911 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 EHD1Q9H4M9 534 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 PLAGL2Q9UPG8 496 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 TCP10L2B9ZVM9 353 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 UNC5CO95185 931 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 RALAP11233 206 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 CBX3Q13185 183 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 TYSND1Q2T9J0 566 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 PIGSQ96S52 555 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 IQGAP1P46940 1657 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM114B3SHH9 223 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 RHOBTB3O94955 611 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 KLK7P49862 253 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 OVGP1Q12889 678 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF235Q14590 738 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SPICE1Q8N0Z3 855 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 MYDGFQ969H8 173 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 EHD4Q9H223 541 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 DMTF1Q9Y222 760 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 PALLDQ8WX93 1383 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ERVV-1B6SEH8 477 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP10.96□□□□□ -0.654e-6■■□□□ 14
SH3BP2-201ENST00000356331 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM253P0C7T8 217 aa10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms