RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OGDHQ02218 1023 aa25.07■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C2orf54Q08AI8 447 aa25.07■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MESDQ14696 234 aa25.07■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DDR2Q16832 855 aa25.07■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa25.07■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OLFML1Q6UWY5 402 aa25.07■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPR152Q8TDT2 470 aa25.07■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CERS4Q9HA82 394 aa25.07■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa25.07■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EHD2Q9NZN4 543 aa25.07■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 STRIP2Q9ULQ0 834 aa25.07■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HSFY1Q96LI6 401 aa25.07■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LILRB3O75022 631 aa25.06■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TKTL1P51854 596 aa25.06■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADCY1Q08828 1119 aa25.06■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa25.06■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DUSP4Q13115 394 aa25.06■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRNP1Q6NT89 227 aa25.06■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FEZF2Q8TBJ5 459 aa25.06■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PBX4Q9BYU1 374 aa25.06■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RAB21Q9UL25 225 aa25.06■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PATJQ8NI35 1801 aa25.06■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CTSAP10619 480 aa25.05■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CLCN6P51797 869 aa25.05■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GSCP56915 257 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TAP1Q03518 808 aa25.05■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SCAMP5Q8TAC9 235 aa25.05■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPPL3Q8TCT6 385 aa25.05■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ACTRT1Q8TDG2 376 aa25.05■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KCTD13Q8WZ19 329 aa25.05■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LRRC4Q9HBW1 653 aa25.05■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SCINQ9Y6U3 715 aa25.05■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CARNS1A5YM72 827 aa25.05■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM191CA6NGB0 347 aa25.05■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CEP104O60308 925 aa25.05■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KRT3P12035 628 aa25.05■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMC7Q7Z402 723 aa25.05■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 POF1BQ8WVV4 589 aa25.05■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ULBP1Q9BZM6 244 aa25.05■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa25.05■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SIGLEC16A6NMB1 481 aa25.04■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GRM6O15303 877 aa25.04■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TEX28O15482 410 aa25.04■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC6A3Q01959 620 aa25.04■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BRD3Q15059 726 aa25.04■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MGAT5BQ3V5L5 792 aa25.04■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RAB41Q5JT25 222 aa25.04■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC70Q6NSX1 233 aa25.04■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DCUN1D2Q6PH85 259 aa25.04■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RASGEF1CQ8N431 466 aa25.04■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PNKPQ96T60 521 aa25.04■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TCF25Q9BQ70 676 aa25.04■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa25.04■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WDR35Q9P2L0 1181 aa25.04■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SEC24AO95486 1093 aa25.03■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CXCL14O95715 111 aa25.03■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CNPP09543 421 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 USP17L7P0C7H9 530 aa25.03■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ACADSBP45954 432 aa25.03■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HIDE1A8MVS5 230 aa25.02■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TNFRSF10BO14763 440 aa25.02■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COMTP21964 271 aa25.02■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC5A3P53794 718 aa25.02■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CAMK1Q14012 370 aa25.02■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLPP4Q5VZY2 271 aa25.02■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HFE2Q6ZVN8 426 aa25.02■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa25.02■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CYLDQ9NQC7 956 aa25.02■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM59LQ9UK28 342 aa25.02■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC151A5D8V7 595 aa25.02■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C5orf67F2Z3F1 127 aa25.02■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPATA31D3P0C874 917 aa25.02■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IRS1P35568 1242 aa25.02■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FLT3P36888 993 aa25.02■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa25.02■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPPL2BQ8TCT7 592 aa25.02■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLVAPQ9BX97 442 aa25.02■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa25.02■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CAPN15O75808 1086 aa25.01■■□□□ 1.59
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ABLIM3O94929 683 aa25.01■■□□□ 1.59
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAGEA11P43364 429 aa25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms