RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278064.6

CFAP43-201, Transcript of cilia and flagella associated protein 43, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CFAP43, Length 2,963 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP43-201ENST00000278064 GSCP56915 257 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 IFNL1Q8IU54 200 aa14.75□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 ANKMY2Q8IV38 441 aa14.75□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 MAML1Q92585 1016 aa14.75□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 PCDH9Q9HC56 1237 aa14.75□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa14.75□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa14.75□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 HEY1Q9Y5J3 304 aa14.75□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 RNF8O76064 485 aa14.75□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 CDH6P55285 790 aa14.75□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 FKBP1BP68106 108 aa14.75□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 ICE2Q659A1 982 aa14.75□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 RGMBQ6NW40 437 aa14.75□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 FAXDC2Q96IV6 333 aa14.75□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa14.75□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 KLC4Q9NSK0 619 aa14.75□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 RRN3P2A6NIE6 340 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 KRT7P08729 469 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 VDRP11473 427 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 ZNF410Q86VK4 478 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 SNX27Q96L92 541 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 USP18Q9UMW8 372 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 SLC12A4Q9UP95 1085 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 NDC80O14777 642 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 GSTA1P08263 222 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 XRCC4Q13426 336 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 TAZQ16635 292 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 CA9Q16790 459 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 FAXCQ5TGI0 409 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 C9orf57Q5W0N0 161 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 C17orf99Q6UX52 265 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 TDRPQ86YL5 185 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 FAM71DQ8N9W8 422 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 GDAP1Q8TB36 358 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 PAAF1Q9BRP4 392 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 SHOC2Q9UQ13 582 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 C2CD2Q9Y426 696 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 IPPQ9Y573 584 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.74□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 ALOX15BO15296 676 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 TMED2Q15363 201 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 HADHQ16836 314 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 NBPF20Q3BBV1 942 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 NUGGCQ68CJ6 796 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 FUKQ8N0W3 1084 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 BEST2Q8NFU1 509 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 SLC2A14Q8TDB8 520 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 GAD1Q99259 594 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 HAUS2Q9NVX0 235 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 WDR35Q9P2L0 1181 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 RASA4BC9J798 803 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 RASA4O43374 803 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 KDELR1P24390 212 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 FLT3LGP49771 235 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 POU5F1BQ06416 359 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 NR1H3Q13133 447 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 BBS12Q6ZW61 710 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 UNC45BQ8IWX7 931 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 FAM149B1Q96BN6 582 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 MAGEB18Q96M61 343 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 COL1A2P08123 1366 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 STX2P32856 288 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 MLH1P40692 756 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 FBXO47Q5MNV8 452 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 TRABD2AQ86V40 505 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 TRIB2Q92519 343 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 HESX1Q9UBX0 185 aa14.73□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 SCN4AP35499 1836 aa14.72□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 CASTOR2A6NHX0 329 aa14.72□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 KPNA7A9QM74 516 aa14.72□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa14.72□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 NDUFV1P49821 464 aa14.72□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 PURAQ00577 322 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 UBXN11Q5T124 520 aa14.72□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 CENPUQ71F23 418 aa14.72□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 TTC13Q8NBP0 860 aa14.72□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CFAP43-201ENST00000278064 ABCF3Q9NUQ8 709 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms