RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223864.6

PLGRKT-201, Transcript of plasminogen receptor with a C-terminal lysine, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLGRKT, Length 932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLGRKT-201ENST00000223864 GTSE1Q9NYZ3 720 aa18.27■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa18.27■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 GCNT4Q9P109 453 aa18.27■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 MYO16Q9Y6X6 1858 aa18.26■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 C2orf78A6NCI8 922 aa18.26■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 TRIM49BA6NDI0 452 aa18.26■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 CKMP06732 381 aa18.26■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 HDCP19113 662 aa18.26■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 CCNE1P24864 410 aa18.26■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC19A1P41440 591 aa18.26■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 MXI1P50539 228 aa18.26■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 PDE6CP51160 858 aa18.26■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 INCA1Q0VD86 236 aa18.26■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 NUP93Q8N1F7 819 aa18.26■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 FBXL13Q8NEE6 735 aa18.26■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 SMARCD1Q96GM5 515 aa18.26■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 FAXDC2Q96IV6 333 aa18.26■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 KCNK16Q96T55 309 aa18.26■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 NIF3L1Q9GZT8 377 aa18.26■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP18.26■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 HMGXB4Q9UGU5 601 aa18.26■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF840PA6NDX5 716 aa18.25■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa18.25■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 CTHP32929 405 aa18.25■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 TNK2Q07912 1038 aa18.25■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 TAF10Q12962 218 aa18.25■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 ORC1Q13415 861 aa18.25■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa18.25■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 DESI1Q6ICB0 168 aa18.25■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 SEMA4DQ92854 862 aa18.25■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 SLITRK1Q96PX8 696 aa18.25■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 LAMTOR5O43504 91 aa18.24■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 CCDC130P13994 396 aa18.24■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 TCF3P15923 654 aa18.24■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 BMP6P22004 513 aa18.24■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 YWHAQP27348 245 aa18.24■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 SOX9P48436 509 aa18.24■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 UBE2HP62256 183 aa18.24■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 RUNX3Q13761 415 aa18.24■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 MORC3Q14149 939 aa18.24■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 TCERG1LQ5VWI1 586 aa18.24■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 FOXR2Q6PJQ5 311 aa18.24■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 FRMD5Q7Z6J6 570 aa18.24■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 C12orf29Q8N999 325 aa18.24■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 TTC8Q8TAM2 541 aa18.24■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 RIN3Q8TB24 985 aa18.24■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC2A14Q8TDB8 520 aa18.24■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 TSC1Q92574 1164 aa18.24■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 NT5C1AQ9BXI3 368 aa18.24■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 DNAI2Q9GZS0 605 aa18.24■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 CHRDQ9H2X0 955 aa18.24■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 LMAN1LQ9HAT1 526 aa18.24■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 KRT82Q9NSB4 513 aa18.24■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 RAB20Q9NX57 234 aa18.24■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 FBXO4Q9UKT5 387 aa18.24■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa18.24■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 ATG2BQ96BY7 2078 aa18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 TNFRSF10BO14763 440 aa18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 CILPO75339 1184 aa18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 AP1G2O75843 785 aa18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 SP9P0CG40 484 aa18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 CHRNB1P11230 501 aa18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 MTF1Q14872 753 aa18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 PDGFRLQ15198 375 aa18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF77Q15935 545 aa18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 TXNDC11Q6PKC3 985 aa18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 LYPD8Q6UX82 237 aa18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 TTC39CQ8N584 583 aa18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 PDZD8Q8NEN9 1154 aa18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 OVCA2Q8WZ82 227 aa18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 CEP63Q96MT8 703 aa18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 TWNKQ96RR1 684 aa18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 IER2Q9BTL4 223 aa18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 EBF3Q9H4W6 596 aa18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 HPS4Q9NQG7 708 aa18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 FAM49BQ9NUQ9 324 aa18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 COMMD8Q9NX08 183 aa18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 IL37Q9NZH6 218 aa18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 COQ4Q9Y3A0 265 aa18.23■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 BIN1O00499 593 aa18.22■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 OLFM2O95897 454 aa18.22■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 ABL1P00519 1130 aa18.22■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 CD58P19256 250 aa18.22■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 USP4Q13107 963 aa18.22■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF528Q3MIS6 628 aa18.22■□□□□ 0.51
PLGRKT-201ENST00000223864 CBWD6Q4V339 395 aa18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms