RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000167462.9

LLGL2-201, Transcript of LLGL2, scribble cell polarity complex component, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LLGL2, Length 3,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2-201ENST00000167462 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 RAB17Q9H0T7 212 aa16.87■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 DDIT4Q9NX09 232 aa16.87■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 PFKMP08237 780 aa16.87■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 IL1R2P27930 398 aa16.87■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 CLEC20AQ6ZU45 233 aa16.87■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 RCOR2Q8IZ40 523 aa16.87■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 SCAMP5Q8TAC9 235 aa16.87■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 ACBD3Q9H3P7 528 aa16.87■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 PSTPIP1O43586 416 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 TUBBP07437 444 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 CLTBP09497 229 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 SYN1P17600 705 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 HADHBP55084 474 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 JAMLQ86YT9 394 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 OR10T2Q8NGX3 314 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 SMARCD1Q96GM5 515 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 C11orf49Q9H6J7 331 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.292e-6■■■□□ 16.3
LLGL2-201ENST00000167462 CAND2O75155 1236 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 ACTN2P35609 894 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 CDK7P50613 346 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 DEUP1Q05D60 604 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 EFHC1Q5JVL4 640 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 CAPN12Q6ZSI9 719 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 HFE2Q6ZVN8 426 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 MAIP1Q8WWC4 291 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 RSAD2Q8WXG1 361 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 TMEM169Q96HH4 297 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 GPR62Q9BZJ7 368 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 ADAM28Q9UKQ2 775 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 PHF2O75151 1096 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 CASP8Q14790 479 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 ZNF354CQ86Y25 554 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 TMLHEQ9NVH6 421 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 DSEQ9UL01 958 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 STAP1Q9ULZ2 295 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa16.86■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 TLDC2A0PJX2 215 aa16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 HMBSP08397 361 aa16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 SLC11A1P49279 550 aa16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 CACNA2D1P54289 1103 aa16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 KRT17Q04695 432 aa16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 IFFO1Q0D2I5 559 aa16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 FAM26DQ5JW98 314 aa16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 ARHGAP17Q68EM7 881 aa16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 LRRTM3Q86VH5 581 aa16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 CCDC89Q8N998 374 aa16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 RNF139Q8WU17 664 aa16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 FAXDC2Q96IV6 333 aa16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 CHRNA3P32297 505 aa16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 COILP38432 576 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 NKX3-2P78367 333 aa16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 BTBD8Q5XKL5 378 aa16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 C4orf50Q6ZRC1 276 aa16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 EXD1Q8NHP7 514 aa16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 TBCBQ99426 244 aa16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 HERPUD2Q9BSE4 406 aa16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 MAGEB5Q9BZ81 275 aa16.85■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 YJEFN3A6XGL0 299 aa16.84■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 E7ENQ6 273 aa16.84■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 PITPNM1O00562 1244 aa16.84■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 ADCY2Q08462 1091 aa16.84■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 NPAS4Q8IUM7 802 aa16.84■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 GIPC2Q8TF65 315 aa16.84■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 MCRS1Q96EZ8 462 aa16.84■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 TSPAN18Q96SJ8 248 aa16.84■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 SMOQ99835 787 aa16.84■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 SEPT10Q9P0V9 454 aa16.84■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 TTLL3Q9Y4R7 772 aa16.84■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 ATP8B3O60423 1300 aa16.84■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 LRRC26Q2I0M4 334 aa16.84■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 CFAP58Q5T655 872 aa16.84■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
LLGL2-201ENST00000167462 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms