RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 DSC3Q14574 896 aa25.05■■□□□ 1.6
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RPUSD1-201ENST00000007264 FAM26DQ5JW98 314 aa25.05■■□□□ 1.6
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RPUSD1-201ENST00000007264 HOOK3Q86VS8 718 aa25.05■■□□□ 1.6
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RPUSD1-201ENST00000007264 CDH9Q9ULB4 789 aa25■■□□□ 1.59
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