RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006015.3

HOXA11-201, Transcript of homeobox A11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA11, Length 2,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11-201ENST00000006015 SETSIPP0DME0 302 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 GHRHRQ02643 423 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 TMEM259Q4ZIN3 620 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 SFT2D3Q587I9 215 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 TFDP3Q5H9I0 405 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 ANO5Q75V66 913 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 SATL1Q86VE3 508 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 SLC44A1Q8WWI5 657 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 SOX13Q9UN79 622 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF862O60290 1169 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 INHBAP08476 426 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 BAG6P46379 1132 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 HMGCS2P54868 508 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 INHBCP55103 352 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 CYP24A1Q07973 514 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 PDIK1LQ8N165 341 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 FAM84AQ96KN4 292 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 COPEO14579 308 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 AP1G1O43747 822 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 CCDC166P0CW27 439 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 MAGEA8P43361 318 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 CHN2P52757 468 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 PSMC5P62195 406 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 BBS9Q3SYG4 887 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 PASD1Q8IV76 773 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 JADE3Q92613 823 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 A0A088AWK7 358 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 SERPINA6P08185 405 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 TCF4P15884 667 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 VCLP18206 1134 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 BACE1P56817 501 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 FAAP100Q0VG06 881 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 C4orf19Q8IY42 314 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 GSTCDQ8NEC7 633 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 SPIRE2Q8WWL2 714 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 BSNDQ8WZ55 320 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 FBXL18Q96ME1 805 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 ACAP3Q96P50 834 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 WRNIP1Q96S55 665 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 WDR64B1ANS9 1081 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 SCNN1BP51168 640 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 AQP4P55087 323 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 TMPRSS15P98073 1019 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 ENPEPQ07075 957 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 BST1Q10588 318 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 PDK3Q15120 406 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 MMEL1Q495T6 779 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 ABRAQ8N0Z2 381 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 TBX20Q9UMR3 447 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 SORCS3Q9UPU3 1222 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 BTBD19C9JJ37 291 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 LYPLA2O95372 231 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 NR3C2P08235 984 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 CPOXP36551 454 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 CDKN2BP42772 138 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 IRX4P78413 519 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 PYDC1Q8WXC3 89 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 E2F7Q96AV8 911 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 BTBD9Q96Q07 612 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 CLIC5Q9NZA1 410 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 GABBR1Q9UBS5 961 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 PEX10O60683 326 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 RGS20O76081 388 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 DESP17661 470 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 AOC1P19801 751 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 NPTX2P47972 431 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 AQP5P55064 265 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 ARHGAP8P85298 464 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 PDE1BQ01064 536 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 PRKG1Q13976 671 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 CRLF3Q8IUI8 442 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 GDPD5Q8WTR4 605 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 HSFX1Q9UBD0 423 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 CHMP2BQ9UQN3 213 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 PFDN1O60925 122 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 TMEM63AO94886 807 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 CFHP08603 1231 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms