RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam198aQ3UY90 562 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atg9bQ6EBV9 922 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cand1Q6ZQ38 1230 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wdr35Q8BND3 1181 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kat14Q8CID0 779 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf426Q8R1D1 550 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tceal1Q921P9 165 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lrp8Q924X6 996 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atad3Q925I1 591 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rnf112Q96DY5 654 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Aldh18a1Q9Z110 795 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Polr2aP08775 1970 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Smok3aC0HKC8 504 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Smok3bC0HKC9 504 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Morc3F7BJB9 942 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ChkaO54804 453 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prkg1P0C605 671 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 L1camP11627 1260 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hoxc10P31257 342 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Smcr8Q3UMB5 935 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tab3Q571K4 716 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nab1Q61122 486 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Grid2Q61625 1007 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ptk6Q64434 451 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fcrl5Q68SN8 596 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Txndc8Q69AB2 127 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 WtipQ7TQJ8 398 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ItpkcQ7TS72 678 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dars2Q8BIP0 653 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 4921504E06RikQ8CET2 560 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tssk3Q9D2E1 268 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tbx20Q9ES03 445 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Chrac1Q9JKP8 129 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SrcapA0A087WQ44 3271 aa17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp651E9PZ11 729 aa17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Axin1O35625 863 aa17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gjb1P28230 283 aa17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Usp10P52479 792 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q8BGA7 448 aa17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Exoc3l1Q8BI71 739 aa17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc9a4Q8BUE1 797 aa17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Phactr3Q8BYK5 558 aa17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wdr27Q8C5V5 780 aa17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rfx6Q8C7R7 927 aa17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TgdsQ8VDR7 355 aa17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Toe1Q9D2E2 511 aa17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PdiltQ9DAN1 588 aa17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plod1Q9R0E2 728 aa17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fgl2P12804 432 aa17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pde6bP23440 856 aa17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfyve27Q3TXX3 415 aa17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pld5Q3UNN8 536 aa17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm8773Q3UQ24 132 aa17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Luc7l3Q5SUF2 432 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf365Q8BG89 408 aa17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tubgcp5Q8BKN5 1024 aa17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tas1r2Q925I4 843 aa17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc25a19Q9DAM5 318 aa17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Scyl3Q9DBQ7 735 aa17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ror1Q9Z139 937 aa17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm17535J3KMR8 224 aa17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hif1aQ61221 836 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ScapQ6GQT6 1276 aa17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mbtd1Q6P5G3 631 aa17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Chn2Q80XD1 332 aa17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q810S2 196 aa17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc68Q8BVC4 333 aa17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf467Q8JZL0 594 aa17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plcb4Q91UZ1 1175 aa17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SncaipQ99ME3 962 aa17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MutyhQ99P21 515 aa17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rpa3Q9CQ71 121 aa17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmco5aQ9D9D5 303 aa17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 B3galt4Q9Z0F0 371 aa17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ankfn1A0A140LIW7 1083 aa17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Abcb5B5X0E4 1255 aa17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AlpiF8VPQ6 554 aa17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spin2fJ3QPU0 254 aa17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Irf6P97431 467 aa17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gata5P97489 404 aa17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sult1d1Q3UZZ6 295 aa17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rpf1Q7TND5 349 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Enpp4Q8BTJ4 456 aa17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hdac7Q8C2B3 938 aa17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Acvr1cQ8K348 493 aa17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mpp5Q9JLB2 675 aa17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Scnn1bQ9WU38 638 aa17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Apol11aE9PZG0 334 aa17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3415J3QMS8 315 aa17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rps12P63323 132 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ranbp9P69566 653 aa17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CttnQ60598 546 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cnksr2Q80YA9 1032 aa17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ttc39bQ8BYY4 617 aa17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mgat5Q8R4G6 740 aa17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr615Q8VGY4 313 aa17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppp1r16bQ8VHQ3 568 aa17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tekt2Q922G7 430 aa17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3404Q9D506 307 aa17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc103Q9D9P2 237 aa17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.8 ms