RNA–Protein interactions for RNA: YLR431C

ATG23, Transcript of Peripheral membrane protein required for autophagy and CVT, yeast

Gene ATG23, Length 1,362 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG23	YLR431C	YLR194C	Q05777	254 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ATG23	YLR431C	YOR072W	Q08486	104 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ATG23	YLR431C	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ATG23	YLR431C	YER039C-A	P0CD97	72 aa		2.81	□□□□□ -1.96
ATG23	YLR431C	PAU19	P0CE85	124 aa		2.81	□□□□□ -1.96
ATG23	YLR431C	PAU3	P25610	124 aa		2.81	□□□□□ -1.96
ATG23	YLR431C	PAU2	P32612	120 aa		2.81	□□□□□ -1.96
ATG23	YLR431C	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
ATG23	YLR431C	YHR130C	P38834	111 aa		2.81	□□□□□ -1.96
ATG23	YLR431C	YJL009W	P47078	108 aa		2.81	□□□□□ -1.96
ATG23	YLR431C	YOL013W-A	P0C272	63 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
ATG23	YLR431C	HUA1	P40325	198 aa		2.8	□□□□□ -1.96
ATG23	YLR431C	PAU5	P43575	122 aa		2.8	□□□□□ -1.96
ATG23	YLR431C	YIL014C-A	Q02598	104 aa		2.8	□□□□□ -1.96
ATG23	YLR431C	YPL261C	Q08976	102 aa		2.8	□□□□□ -1.96
ATG23	YLR431C	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
ATG23	YLR431C	PAU23	Q07987	124 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ATG23	YLR431C	PAU17	Q12370	124 aa		2.79	□□□□□ -1.96
ATG23	YLR431C	PAI3	P01094	68 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ATG23	YLR431C	OST5	Q92316	86 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ATG23	YLR431C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	YEA6	P39953	335 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	COX9	P07255	59 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	YER187W	P40102	141 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	DAD1	Q12248	94 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	YOS1	Q3E834	85 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	YBR292C	P38357	123 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	YNL198C	P40166	100 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	MGR2	Q02889	113 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	PAU1	P0CE88	120 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	PAU14	P0CE89	120 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	PAU6	P0CE90	120 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	PAU18	P0CE91	120 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	PAU8	P0CE92	120 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	PAU11	P0CE93	120 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	PAU16	P35994	123 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	PAU13	P38725	120 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	YIL163C	P40448	117 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	PAU4	P53427	120 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	PAU10	Q03050	120 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	PAU20	Q08322	120 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	PAU9	Q3E770	120 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	MIC27	P50945	234 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	YMR082C	Q04276	118 aa		2.72	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		2.72	□□□□□ -1.97
ATG23	YLR431C	YGR164W	P53291	111 aa		2.71	□□□□□ -1.98
ATG23	YLR431C	YMR321C	Q04898	105 aa		2.71	□□□□□ -1.98
ATG23	YLR431C	COA2	Q3E823	68 aa		2.71	□□□□□ -1.98
ATG23	YLR431C	HFA1	P32874	2273 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ATG23	YLR431C	SRX1	P36077	127 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ATG23	YLR431C	ATX1	P38636	73 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG23	YLR431C	COX23	P38824	151 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG23	YLR431C	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ATG23	YLR431C	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ATG23	YLR431C	YOR105W	Q08504	108 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG23	YLR431C	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATG23	YLR431C	CYB5	P40312	120 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATG23	YLR431C	POR2	P40478	281 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATG23	YLR431C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ATG23	YLR431C	TIM12	P32830	109 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ATG23	YLR431C	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
ATG23	YLR431C	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ATG23	YLR431C	ENV10	Q99382	181 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ATG23	YLR431C	HMRA1	P0CY11	126 aa		2.65	□□□□□ -1.98
ATG23	YLR431C	YBR090C	P38253	122 aa		2.65	□□□□□ -1.98
ATG23	YLR431C	HHY1	P39982	102 aa		2.65	□□□□□ -1.98
ATG23	YLR431C	MVB12	P42939	101 aa		2.65	□□□□□ -1.98
ATG23	YLR431C	FIT3	Q08907	204 aa		2.65	□□□□□ -1.98
ATG23	YLR431C	QCR9	P22289	66 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ATG23	YLR431C	CWP2	P43497	92 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ATG23	YLR431C	HUR1	P45820	110 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ATG23	YLR431C	YMR103C	Q04436	120 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ATG23	YLR431C	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ATG23	YLR431C	YIR020C	P40575	100 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ATG23	YLR431C	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ATG23	YLR431C	YHR213W-B	Q8TGK1	99 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ATG23	YLR431C	HMRA2	P0CY13	119 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ATG23	YLR431C	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ATG23	YLR431C	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ATG23	YLR431C	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ATG23	YLR431C	ICS3	P47034	131 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ATG23	YLR431C	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ATG23	YLR431C	YOL118C	Q08259	102 aa		2.59	□□□□□ -2
ATG23	YLR431C	YDR029W	Q12111	104 aa		2.59	□□□□□ -2
ATG23	YLR431C	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		2.59	□□□□□ -2
ATG23	YLR431C	ECM12	O13529	151 aa		2.58	□□□□□ -2
ATG23	YLR431C	YDR042C	Q03205	200 aa		2.58	□□□□□ -2
ATG23	YLR431C	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		2.58	□□□□□ -2
ATG23	YLR431C	UBC5	P15732	148 aa		2.57	□□□□□ -2
ATG23	YLR431C	YCR085W	P25650	117 aa		2.57	□□□□□ -2
ATG23	YLR431C	YOR343C	Q12484	108 aa		2.57	□□□□□ -2
ATG23	YLR431C	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		2.57	□□□□□ -2
ATG23	YLR431C	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		2.57	□□□□□ -2
ATG23	YLR431C	TOM7	P53507	60 aa		2.56	□□□□□ -2

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