RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeastyeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4YKL049C MPC2P38857 129 aa1.35□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C PEX17P40155 199 aa1.35□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C BLM10P43583 2143 aa1.35□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C VPS55P47111 140 aa1.35□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C TOS6P48560 102 aa1.35□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C SIP18P50263 79 aa1.35□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C SBH1P52870 82 aa1.35□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C SBH2P52871 88 aa1.35□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YNR077CP53758 84 aa1.35□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C MGR2Q02889 113 aa1.35□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C COA3Q3E7B2 85 aa1.35□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YOR032W-AQ8TGS1 66 aa1.35□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C CCW14O13547 238 aa1.34□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C RPL39P04650 51 aa1.34□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YEL067CP39978 195 aa1.34□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C ERG28P40030 148 aa1.34□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YER135CP40082 130 aa1.34□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C DCV1P43595 202 aa1.34□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YNL190WP53872 204 aa1.34□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C COX12Q01519 83 aa1.34□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YDR119W-AQ2V2P9 66 aa1.34□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YPL038W-AQ3E7B4 63 aa1.34□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C KTI11Q3E840 82 aa1.34□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C QCR8P08525 94 aa1.33□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YHR213WP0CI67 198 aa1.33□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C UBC5P15732 148 aa1.33□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C SHU1P38751 150 aa1.33□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C SPI1P40092 148 aa1.33□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YNL194CP40169 301 aa1.33□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C POR2P40478 281 aa1.33□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C IRC23Q08416 157 aa1.33□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YDR381C-AQ3E6R5 114 aa1.33□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YLR285C-AQ3E771 56 aa1.33□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YOR020W-AQ3E824 90 aa1.33□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YKR045CP36138 183 aa1.32□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C AIM4P38305 123 aaPredicted RBP1.32□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C SVP26P38869 228 aa1.32□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C TDA2P40045 126 aa1.32□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YER187WP40102 141 aa1.32□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C IMP2P46972 177 aa1.32□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C RPL38P49167 78 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YMR295CQ03559 197 aa1.32□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C IRC21Q04772 201 aa1.32□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YMR320WQ04897 101 aa1.32□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C SHH4Q06236 168 aa1.32□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C TSC3Q3E790 80 aa1.32□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP1.32□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YDL022C-AP0C5L6 82 aa1.31□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YJR107C-AP0CT86 78 aa1.31□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YAR029WP39549 74 aa1.31□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C ALG13P53178 202 aa1.31□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C PMP3P87284 55 aa1.31□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YOL160WQ08321 113 aa1.31□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C ATP20Q12233 115 aa1.31□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YOR034C-AQ3E735 80 aa1.31□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YKL183C-AQ3E765 70 aa1.31□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa1.31□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YOR011W-AQ3E807 68 aa1.31□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YMR105W-AQ8TGS8 64 aa1.31□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C FAS1P07149 2051 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C SEC16P48415 2195 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C BRR2P32639 2163 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YLR156WP0CE96 114 aa1.3□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YLR159WP0CE97 114 aa1.3□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YLR161WP0CE98 114 aa1.3□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YBR219CP38317 127 aa1.3□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YEL008WP40001 126 aa1.3□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YIL102CP40488 101 aa1.3□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C SED1Q01589 338 aa1.3□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YOR314WQ12506 109 aa1.3□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YLR412C-AQ3E742 68 aa1.3□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YBR200W-AQ3E755 54 aa1.3□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C UBC4P15731 148 aa1.29□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C RSM18P40033 138 aa1.29□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YIR020CP40575 100 aa1.29□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YFL019CP43576 117 aa1.29□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C TOS8P53147 276 aa1.29□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C MPC3P53311 146 aa1.29□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C MRPS12P53732 153 aa1.29□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C RSM19P53733 91 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C ATP18P81450 59 aa1.29□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C ICY1Q04329 127 aa1.29□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa1.29□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YNL277W-AQ3E7Z0 62 aa1.29□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YOR381W-AQ3E804 55 aa1.29□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YLL006W-AQ3E814 58 aa1.29□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C KSH1Q8TGJ3 72 aa1.29□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C POL2P21951 2222 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C RPL33BP41056 107 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YFR035CP43608 114 aa1.28□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C SFT1P43682 97 aa1.28□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C SPC1P46965 94 aa1.28□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YGR025WP53216 100 aa1.28□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C YGR164WP53291 111 aa1.28□□□□□ -2.2
CSE4YKL049C SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 314.6 ms