RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W ELC1Q03071 99 aa6.17□□□□□ -1.42
DDI1YER143W ADH1P00330 348 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
DDI1YER143W YAL064WP39711 94 aa6.16□□□□□ -1.42
DDI1YER143W PPT2Q12036 173 aa6.16□□□□□ -1.42
DDI1YER143W YML079WQ03629 201 aa6.15□□□□□ -1.42
DDI1YER143W VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data6.15□□□□□ -1.42not detected
DDI1YER143W CWP2P43497 92 aa6.14□□□□□ -1.43
DDI1YER143W CWC27Q02770 301 aa6.14□□□□□ -1.43
DDI1YER143W YLR296WQ05898 108 aa6.14□□□□□ -1.43
DDI1YER143W YDL241WQ07738 123 aa6.14□□□□□ -1.43
DDI1YER143W YKL023C-AQ2V2P3 75 aa6.14□□□□□ -1.43
DDI1YER143W MBF1O14467 151 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
DDI1YER143W YPR170W-BP0C5R9 85 aa6.13□□□□□ -1.43
DDI1YER143W MID2P36027 376 aa6.12□□□□□ -1.43
DDI1YER143W YPR195CQ06594 109 aa6.12□□□□□ -1.43
DDI1YER143W RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
DDI1YER143W UBC11P52492 156 aa6.11□□□□□ -1.43
DDI1YER143W RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
DDI1YER143W UIP3P39547 235 aa6.1□□□□□ -1.43
DDI1YER143W YAR023CD6VPM8 179 aa6.09□□□□□ -1.43
DDI1YER143W CDC43P18898 376 aa6.09□□□□□ -1.43
DDI1YER143W YER181CP40097 107 aa6.09□□□□□ -1.43
DDI1YER143W YLL006W-AQ3E814 58 aa6.09□□□□□ -1.43
DDI1YER143W PAI3P01094 68 aa6.08□□□□□ -1.44
DDI1YER143W CPR1P14832 162 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
DDI1YER143W DUT1P33317 147 aa6.07□□□□□ -1.44
DDI1YER143W YNL198CP40166 100 aa6.07□□□□□ -1.44
DDI1YER143W YIL102C-AQ2V2P5 75 aa6.07□□□□□ -1.44
DDI1YER143W AQY2P0CD90 149 aa6.05□□□□□ -1.44
DDI1YER143W YIA6P40556 373 aa6.05□□□□□ -1.44
DDI1YER143W MVB12P42939 101 aa6.05□□□□□ -1.44
DDI1YER143W RGM1Q00453 211 aa6.05□□□□□ -1.44
DDI1YER143W POP7P38291 140 aa6.04□□□□□ -1.44
DDI1YER143W LSM6Q06406 86 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
DDI1YER143W STF1P01098 86 aa6.03□□□□□ -1.44
DDI1YER143W RPL29P05747 59 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
DDI1YER143W HPA2Q06592 156 aa6.03□□□□□ -1.44
DDI1YER143W YOR020W-AQ3E824 90 aa6.03□□□□□ -1.44
DDI1YER143W YPL229WQ99395 206 aa6.03□□□□□ -1.44
DDI1YER143W SMP1P38128 452 aa6.02□□□□□ -1.45
DDI1YER143W ANB1P19211 157 aa6.01□□□□□ -1.45
DDI1YER143W YHR130CP38834 111 aa6.01□□□□□ -1.45
DDI1YER143W YFL019CP43576 117 aa6.01□□□□□ -1.45
DDI1YER143W SNA2P56508 79 aa6.01□□□□□ -1.45
DDI1YER143W SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
DDI1YER143W ABF2Q02486 183 aa6.01□□□□□ -1.45
DDI1YER143W ARO2P28777 376 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
DDI1YER143W IGD1P43598 195 aa6□□□□□ -1.45
DDI1YER143W TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
DDI1YER143W YBL039W-BP0C268 59 aa5.99□□□□□ -1.45
DDI1YER143W NHP2P32495 156 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
DDI1YER143W YDR029WQ12111 104 aa5.99□□□□□ -1.45
DDI1YER143W YDR034C-AP0C289 58 aa5.98□□□□□ -1.45
DDI1YER143W AIM19P40502 157 aa5.98□□□□□ -1.45
DDI1YER143W EOS1P53938 366 aa5.98□□□□□ -1.45
DDI1YER143W RPP2AP05319 106 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
DDI1YER143W KNH1P50112 268 aa5.97□□□□□ -1.45
DDI1YER143W IRC21Q04772 201 aa5.97□□□□□ -1.45
DDI1YER143W YNL162W-AQ3E7A8 72 aa5.97□□□□□ -1.45
DDI1YER143W COX10P21592 462 aa5.96□□□□□ -1.46
DDI1YER143W HYP2P23301 157 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
DDI1YER143W PEX22P39718 180 aa5.96□□□□□ -1.46
DDI1YER143W YOR034C-AQ3E735 80 aa5.96□□□□□ -1.46
DDI1YER143W UBC4P15731 148 aa5.95□□□□□ -1.46
DDI1YER143W YLR307C-AQ3E825 87 aa5.95□□□□□ -1.46
DDI1YER143W ICY1Q04329 127 aa5.94□□□□□ -1.46
DDI1YER143W LCL2Q08045 131 aa5.94□□□□□ -1.46
DDI1YER143W YLR236CA0A023PZG4 107 aa5.93□□□□□ -1.46
DDI1YER143W ECM12O13529 151 aa5.92□□□□□ -1.46
DDI1YER143W MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
DDI1YER143W HUR1P45820 110 aa5.92□□□□□ -1.46
DDI1YER143W YGL041C-BQ3E750 60 aa5.92□□□□□ -1.46
DDI1YER143W GAT4P40569 121 aa5.91□□□□□ -1.46
DDI1YER143W Q0032Q9ZZX7 96 aa5.91□□□□□ -1.46
DDI1YER143W MSA2P36157 363 aa5.89□□□□□ -1.47
DDI1YER143W YGL193CP53097 103 aa5.88□□□□□ -1.47
DDI1YER143W YBR230W-AQ3E762 66 aa5.87□□□□□ -1.47
DDI1YER143W RPL26AP05743 127 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
DDI1YER143W RPL26BP53221 127 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
DDI1YER143W MPC3P53311 146 aa5.85□□□□□ -1.47
DDI1YER143W YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa5.84□□□□□ -1.47
DDI1YER143W FYV5P25585 152 aa5.83□□□□□ -1.48
DDI1YER143W YJL127C-BQ3E828 52 aa5.83□□□□□ -1.48
DDI1YER143W DSE2P38844 325 aa5.82□□□□□ -1.48
DDI1YER143W YPL257WQ08974 193 aa5.81□□□□□ -1.48
DDI1YER143W YLR156WP0CE96 114 aa5.79□□□□□ -1.48
DDI1YER143W YLR159WP0CE97 114 aa5.79□□□□□ -1.48
DDI1YER143W YLR161WP0CE98 114 aa5.79□□□□□ -1.48
DDI1YER143W RPA12P32529 125 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
DDI1YER143W GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data5.78□□□□□ -1.48not detected
DDI1YER143W LCL1Q02786 101 aa5.78□□□□□ -1.48
DDI1YER143W YJR107C-AP0CT86 78 aa5.77□□□□□ -1.49
DDI1YER143W SPT4P32914 102 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
DDI1YER143W YER039C-AP0CD97 72 aa5.75□□□□□ -1.49
DDI1YER143W DDR2P89113 61 aa5.75□□□□□ -1.49
DDI1YER143W OST2P46964 130 aa5.74□□□□□ -1.49
DDI1YER143W YKL069WP36088 180 aa5.72□□□□□ -1.49
DDI1YER143W SFT1P43682 97 aa5.72□□□□□ -1.49
DDI1YER143W BET1P22804 142 aa5.71□□□□□ -1.5
DDI1YER143W MMS2P53152 137 aa5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 774.5 ms