RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	SPC1	P46965	94 aa		2.49	□□□□□ -2.01
SLX8	YER116C	TY4B-J	P47024	1803 aa		2.48	□□□□□ -2.01
SLX8	YER116C	MRX7	P53869	86 aa		2.48	□□□□□ -2.01
SLX8	YER116C	SNA2	P56508	79 aa		2.48	□□□□□ -2.01
SLX8	YER116C	YDR210W	Q03482	75 aa		2.48	□□□□□ -2.01
SLX8	YER116C	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		2.48	□□□□□ -2.01
SLX8	YER116C	PMD1	P32634	1753 aa		2.48	□□□□□ -2.01
SLX8	YER116C	UFD4	P33202	1483 aa		2.47	□□□□□ -2.01
SLX8	YER116C	YBL071C	P38185	102 aa		2.47	□□□□□ -2.01
SLX8	YER116C	YBR219C	P38317	127 aa		2.47	□□□□□ -2.01
SLX8	YER116C	IRC21	Q04772	201 aa		2.47	□□□□□ -2.01
SLX8	YER116C	CCW12	Q12127	133 aa		2.47	□□□□□ -2.01
SLX8	YER116C	COA3	Q3E7B2	85 aa		2.47	□□□□□ -2.01
SLX8	YER116C	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		2.47	□□□□□ -2.01
SLX8	YER116C	PAU6	P0CE90	120 aa		2.46	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	PAU18	P0CE91	120 aa		2.46	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	MRPS12	P53732	153 aa		2.46	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	PAU23	Q07987	124 aa		2.46	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	PAU17	Q12370	124 aa		2.46	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	YOR314W	Q12506	109 aa		2.46	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	HAP1	P0CE41	1502 aa		2.46	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		2.46	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		2.46	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		2.46	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	VPS15	P22219	1454 aa		2.45	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	MYO4	P32492	1471 aa		2.45	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		2.45	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	YLR162W	Q06235	118 aa		2.45	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		2.45	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		2.45	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	SSK2	P53599	1579 aa		2.44	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		2.44	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	YNL198C	P40166	100 aa		2.44	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	LCL2	Q08045	131 aa		2.44	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	PRM7	Q12459	698 aa		2.44	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		2.44	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	2.43	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	2.43	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	YAL065C	O13511	128 aa		2.43	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	YOR105W	Q08504	108 aa		2.43	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		2.43	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	2.42	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	COX12	Q01519	83 aa		2.42	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	MPC2	P38857	129 aa		2.41	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		2.41	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	MOT1	P32333	1867 aa		2.41	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	2.41	□□□□□ -2.02
SLX8	YER116C	VMA9	Q3E7B6	73 aa		2.4	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		2.4	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		2.4	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	BPH1	P25356	2167 aa		2.4	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	2.39	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	2.39	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	2.39	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	TIM12	P32830	109 aa		2.39	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	AIM19	P40502	157 aa		2.39	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	BSC4	P53841	131 aa		2.39	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	YDL012C	Q12489	107 aa		2.39	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		2.39	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	APC1	P53886	1748 aa		2.39	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	2.38	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	SPO14	P36126	1683 aa		2.38	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	2.37	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	PAU8	P0CE92	120 aa		2.37	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	PAU11	P0CE93	120 aa		2.37	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	2.37	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	PAU13	P38725	120 aa		2.37	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	YJL009W	P47078	108 aa		2.37	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	PAU4	P53427	120 aa		2.37	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	PAU10	Q03050	120 aa		2.37	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	COX19	Q3E731	98 aa		2.37	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	PAU9	Q3E770	120 aa		2.37	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	QCR9	P22289	66 aa		2.36	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	YNL122C	P53921	115 aa	Predicted RBP	2.36	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	YDR010C	Q12426	110 aa		2.36	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	2.35	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	YLR255C	O13574	117 aa		2.35	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	PAU1	P0CE88	120 aa		2.35	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	PAU14	P0CE89	120 aa		2.35	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	YIL156W-B	Q2V2P4	73 aa		2.35	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		2.35	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		2.35	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	NOP10	Q6Q547	58 aa	Predicted RBP	2.35	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	HFA1	P32874	2273 aa		2.34	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	RIM15	P43565	1770 aa		2.34	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	YHR173C	P38864	112 aa		2.34	□□□□□ -2.03
SLX8	YER116C	VTH1	P40438	1549 aa		2.33	□□□□□ -2.04
SLX8	YER116C	VTH2	P40890	1549 aa		2.33	□□□□□ -2.04
SLX8	YER116C	IML1	P47170	1584 aa		2.33	□□□□□ -2.04
SLX8	YER116C	SPI1	P40092	148 aa		2.33	□□□□□ -2.04
SLX8	YER116C	CDC25	P04821	1589 aa		2.32	□□□□□ -2.04
SLX8	YER116C	IRC20	Q06554	1556 aa		2.32	□□□□□ -2.04
SLX8	YER116C	MMS1	Q06211	1407 aa		2.32	□□□□□ -2.04
SLX8	YER116C	BCK1	Q01389	1478 aa		2.32	□□□□□ -2.04
SLX8	YER116C	PAU20	Q08322	120 aa		2.31	□□□□□ -2.04
SLX8	YER116C	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		2.31	□□□□□ -2.04
SLX8	YER116C	TY3B-G	Q99315	1547 aa		2.31	□□□□□ -2.04
SLX8	YER116C	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	2.3	□□□□□ -2.04
SLX8	YER116C	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		2.3	□□□□□ -2.04
SLX8	YER116C	FPR2	P32472	135 aa		2.3	□□□□□ -2.04

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