RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 LOXL4Q96JB6 756 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 VPS16Q9H269 839 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 IKZF4Q9H2S9 585 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 TMLHEQ9NVH6 421 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 EXOC7Q9UPT5 735 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 ASPMQ8IZT6 3477 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 CYB561D2O14569 222 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 RUNX3Q13761 415 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM14Q14142 442 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 EFCAB13Q8IY85 973 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 STKLD1Q8NE28 680 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 EBF3Q9H4W6 596 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 ASB7Q9H672 318 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 C2CD2Q9Y426 696 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 STYXL1Q9Y6J8 313 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP25.74■■□□□ 1.718e-17■□□□□ 10.3
CAPNS1-216ENST00000628306 ZZEF1O43149 2961 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 RPP40O75818 363 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 NR3C1P04150 777 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 NR2F2P24468 414 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR15P49685 360 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 VEPH1Q14D04 833 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 VWA3BQ502W6 1294 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 MIIPQ5JXC2 388 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 ERGIC2Q96RQ1 377 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 DSEQ9UL01 958 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 TADA3O75528 432 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 EGFP01133 1207 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 ARSAP15289 507 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 WNT7BP56706 349 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 UBXN1Q04323 297 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 SCARA3Q6AZY7 606 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM59Q8IWR1 403 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 MAB21L3Q8N8X9 362 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 SPPL2BQ8TCT7 592 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 NDST4Q9H3R1 872 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 SMOC1Q9H4F8 434 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 TAF6P49848 677 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNA1Q09470 495 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 FKBP15Q5T1M5 1219 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 TXNDC8Q6A555 127 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 NUP58Q9BVL2 599 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 DPP3Q9NY33 737 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 MAPK13O15264 365 aa25.7■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 SMARCB1Q12824 385 aa25.7■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 FIGNQ5HY92 759 aa25.7■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 CREBRFQ8IUR6 639 aa25.7■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 GCNAQ96QF7 691 aa25.7■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 ZMYM5Q9UJ78 669 aa25.7■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 NRDCO43847 1150 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF40O75150 1001 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 AKAP3O75969 853 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 ADSSP30520 456 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 SHC2P98077 582 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC40Q4G0X9 1142 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 STPG1Q5TH74 334 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 IL31Q6EBC2 164 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 SYCP3Q8IZU3 236 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC112Q8NEF3 446 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNF1Q9H3M0 494 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 TDP1Q9NUW8 608 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 MYO16Q9Y6X6 1858 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 SPEGQ15772 3267 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 GALK1P51570 392 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 PLK5Q496M5 336 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 SDHAF4Q5VUM1 108 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 MON1AQ86VX9 555 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 METTL23Q86XA0 190 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 PKMYT1Q99640 499 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 KPNA7A9QM74 516 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 TPM1P09493 284 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 EPB41P11171 864 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 MSNP26038 577 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 AVPR1AP37288 418 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
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