RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KCNC3Q14003 757 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MEA1Q16626 185 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PTPN20Q4JDL3 420 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PKDCCQ504Y2 493 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRIM72Q6ZMU5 477 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NUP93Q8N1F7 819 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WDTC1Q8N5D0 677 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OLIG1Q8TAK6 271 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CLEC4CQ8WTT0 213 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FBXO32Q969P5 355 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC42Q96M95 316 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NOX5Q96PH1 765 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CPXM1Q96SM3 734 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ULBP1Q9BZM6 244 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CLEC1BQ9P126 229 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HSFX1Q9UBD0 423 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAFFQ9ULX9 164 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GOLGA8SH3BPF8 625 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LSM8O95777 96 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ERBB2P04626 1255 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 USP17L7P0C7H9 530 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CSH1P0DML2 217 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CSH2P0DML3 217 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GJA1P17302 382 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KIF11P52732 1056 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MTF1Q14872 753 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SYCE2Q6PIF2 218 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CYP26C1Q6V0L0 522 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ITIH5Q86UX2 942 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MSANTD4Q8NCY6 345 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HDAC7Q8WUI4 952 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC35F5Q8WV83 523 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PSMG2Q969U7 264 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SPATA17Q96L03 361 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SYT11Q9BT88 431 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRKD2Q9BZL6 878 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LHX5Q9H2C1 402 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ASAH2Q9NR71 780 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GMIPQ9P107 970 aa15.32■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DOCK6Q96HP0 2047 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 A0A087X0T9 212 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TNFRSF10BO14763 440 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM228BP0C875 321 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ABCB4P21439 1286 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CYP4F8P98187 520 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC173Q0VFZ6 552 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC122Q5T0U0 273 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR6B2Q6IFH4 312 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ERICH1Q86X53 443 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ING5Q8WYH8 240 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GCNAQ96QF7 691 aa15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 A0A1W2PRU2 124 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NCK2O43639 380 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GABBR2O75899 941 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RHOP08100 348 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UNGP13051 313 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PTPN2P17706 415 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SP100P23497 879 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 YWHAQP27348 245 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GABRR2P28476 465 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HOXA9P31269 272 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LTBRP36941 435 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CENPCQ03188 943 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TAF10Q12962 218 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CTC1Q2NKJ3 1217 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SMYD5Q6GMV2 418 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CES5AQ6NT32 575 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM149B1Q96BN6 582 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TCEAL4Q96EI5 215 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRPC7Q9HCX4 862 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PNPLA8Q9NP80 782 aa15.3■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRDM6Q9NQX0 595 aa15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms