RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592170.5

SEH1L-209, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 5

Gene SEH1L, Length 787 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-209ENST00000592170 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PIK3R5Q8WYR1 880 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PCED1BQ96HM7 432 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 ASB2Q96Q27 587 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 TSGA10Q9BZW7 698 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 LACRTQ9GZZ8 138 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 LZTFL1Q9NQ48 299 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 CHST7Q9NS84 486 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 KRT82Q9NSB4 513 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 TMLHEQ9NVH6 421 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 THEGQ9P2T0 379 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 MTRRQ9UBK8 725 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 TRIM10Q9UDY6 481 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 CYTH4Q9UIA0 394 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 GTF3C4Q9UKN8 822 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 INTUQ9ULD6 942 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 RWDD3Q9Y3V2 267 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 CDH23Q9H251 3354 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 NCANO14594 1321 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 KRT86O43790 486 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 TBC1D4O60343 1298 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 ARHGEF15O94989 841 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 TMEM253P0C7T8 217 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 FAM200BP0CF97 657 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 SETSIPP0DME0 302 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 IGFBP4P22692 258 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 BMPR1AP36894 532 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PLA2G5P39877 138 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 GLUD2P49448 558 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 CDR1P51861 262 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 SH3BP2P78314 561 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 DSG1Q02413 1049 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 KRT17Q04695 432 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PDE4CQ08493 712 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PTP4A2Q12974 167 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PDCLQ13371 301 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PSMD5Q16401 504 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PTPN20Q4JDL3 420 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 SLC39A12Q504Y0 691 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 KIAA1841Q6NSI8 718 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 LRRTM3Q86VH5 581 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 MCOLN2Q8IZK6 566 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 KLHL23Q8NBE8 558 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 ZNF653Q96CK0 615 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 ARHGEF26Q96DR7 871 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 TRIM11Q96F44 468 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 NOX5Q96PH1 765 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 C11orf70Q9BRQ4 267 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 DUSP16Q9BY84 665 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 THAP2Q9H0W7 228 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 ADAM22Q9P0K1 906 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 STK39Q9UEW8 545 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa11.1□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 BTNL10A8MVZ5 291 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 TULP2O00295 520 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 C2CD2LO14523 706 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 ABL1P00519 1130 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 CALB1P05937 261 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 URODP06132 367 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 CA3P07451 260 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 MYBL1P10243 752 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 CPB1P15086 417 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 NPR3P17342 541 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 MMP8P22894 467 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 ARPP19P56211 112 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 GPC5P78333 572 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 C2CD6Q53TS8 623 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 LIN9Q5TKA1 542 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 C4orf50Q6ZRC1 276 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 ERICH1Q86X53 443 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 VPS52Q8N1B4 723 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 MSANTD4Q8NCY6 345 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 SLC35F5Q8WV83 523 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 SMARCD1Q96GM5 515 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 VCPIP1Q96JH7 1222 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 CPXM1Q96SM3 734 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 C17orf80Q9BSJ5 609 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PLVAPQ9BX97 442 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 ZBP1Q9H171 429 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PRDM12Q9H4Q4 367 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 MYO1AQ9UBC5 1043 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 GUCA1BQ9UMX6 200 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 BACE2Q9Y5Z0 518 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 CDY1Q9Y6F8 540 aa11.09□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 DUSP10Q9Y6W6 482 aa11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms