RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC11A1P49279 550 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 VSNL1P62760 191 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC14Q49A88 953 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC43Q8N309 656 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 PRELID2Q8N945 189 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 ZMIZ2Q8NF64 920 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 ADAM28Q9UKQ2 775 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 FAN1Q9Y2M0 1017 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 HHLA1C9JL84 531 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 SART1O43290 800 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 PHF2O75151 1096 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 LCP1P13796 627 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 TNFRSF8P28908 595 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 CETN2P41208 172 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 CLCN6P51797 869 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 MAP3K7CLP57077 242 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRTM3Q86VH5 581 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 KLHL7Q8IXQ5 586 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 SCML4Q8N228 414 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 HDAC7Q8WUI4 952 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC4Q9HBW1 653 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 PNPLA8Q9NP80 782 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 TMLHEQ9NVH6 421 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 STIM2Q9P246 746 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM43BA6NCK2 446 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 RAD51CO43502 376 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 GALTP07902 379 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 RARAP10276 462 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 FGFR3P22607 806 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 MIPP30301 263 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 CHRNA3P32297 505 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 TAF5Q15542 800 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 TAZQ16635 292 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC26Q8TAB7 109 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 CLEC4CQ8WTT0 213 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 RUNDC3BQ96NL0 473 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 SLITRK1Q96PX8 696 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 OSBPL8Q9BZF1 889 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 GDF3Q9NR23 364 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 NLRC5Q86WI3 1866 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPRDP23468 1912 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 HSF2BPO75031 334 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 EFCAB14O75071 495 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 DGKIO75912 1065 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT1P04264 644 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 IL1R2P27930 398 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 SDC4P31431 198 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 ADIGQ0VDE8 80 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 C4orf50Q6ZRC1 276 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 MAATS1Q7Z4T9 603 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM209Q96SK2 561 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC19Q9H756 370 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 CNGB3Q9NQW8 809 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM30AQ9NV96 361 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 EFR3BQ9Y2G0 817 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 COL4A6Q14031 1691 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 ERLIN1O75477 346 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 DAB1O75553 588 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 GRAP2O75791 330 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 EFEMP2O95967 443 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 DESP17661 470 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 CACNA2D1P54289 1103 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 TOP1MTQ969P6 601 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 PCYOX1Q9UHG3 505 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 USP18Q9UMW8 372 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP23.85■■□□□ 1.419e-10■■■■□ 24.3
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM187AA6NFU0 413 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 OR6C75A6NL08 312 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 RALAP11233 206 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 ITGB8P26012 769 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 FNTAP49354 379 aa23.85■■□□□ 1.41
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