RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 ARSAP15289 507 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 ADORA2BP29275 332 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 CTHP32929 405 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 NBL1P41271 181 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 PRCPP42785 496 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 MAGEA9P43362 315 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 NDST1P52848 882 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 PLCB2Q00722 1185 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 PPP3CAQ08209 521 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 MTAPQ13126 283 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 KLHL10Q6JEL2 608 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 TAS1R2Q8TE23 839 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 FBXO32Q969P5 355 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC22A12Q96S37 553 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 OSBPL6Q9BZF3 934 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 KIF9Q9HAQ2 790 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 LMAN1LQ9HAT1 526 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 MYO16Q9Y6X6 1858 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 HELZP42694 1942 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 TRIM49BA6NDI0 452 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 PRR23AA6NEV1 266 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 IKBKBO14920 756 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 AP1G2O75843 785 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 HDCP19113 662 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 ASPAP45381 313 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 IFNAR2P48551 515 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 MXI1P50539 228 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CLDN10P78369 228 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 TAF10Q12962 218 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 STIM1Q13586 685 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 LRRC32Q14392 662 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 MTF1Q14872 753 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 EDRF1Q3B7T1 1238 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 ZCWPW2Q504Y3 356 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 C1orf220Q5T0J3 134 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 TXNDC11Q6PKC3 985 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 NUDT18Q6ZVK8 323 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 RIN3Q8TB24 985 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 SH3RF2Q8TEC5 729 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 SMARCD1Q96GM5 515 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 SPATA17Q96L03 361 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 MYRFLQ96LU7 910 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 SLITRK1Q96PX8 696 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 NIF3L1Q9GZT8 377 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 VRTNQ9H8Y1 702 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM8AQ9HCN3 771 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 TRPV5Q9NQA5 729 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM30AQ9NV96 361 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 SMPD4Q9NXE4 827 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 EHD2Q9NZN4 543 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 WNT6Q9Y6F9 365 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CACNA1HO95180 2353 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 SHISA7A6NL88 538 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 BIN1O00499 593 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 PSMA7O14818 248 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 MAPK13O15264 365 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 ASS1P00966 412 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 RPS9P46781 194 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC5A3P53794 718 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 PMS1P54277 932 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 RUNX3Q13761 415 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 NFIL3Q16649 462 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF394Q53GI3 561 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 Q6ZS52 159 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 NUP93Q8N1F7 819 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CPA6Q8N4T0 437 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 ENGASEQ8NFI3 743 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC2A14Q8TDB8 520 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 TAF4BQ92750 862 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 MSANTD3Q96H12 275 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 C8orf48Q96LL4 319 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 GSDMAQ96QA5 445 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 KCNK16Q96T55 309 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 NACA2Q9H009 215 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CHRDQ9H2X0 955 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 HPS4Q9NQG7 708 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CTNND2Q9UQB3 1225 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 STX10O60499 249 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM163BP0C2L3 166 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM200BP0CF97 657 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 YWHAQP27348 245 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 WEE1P30291 646 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 PDE6CP51160 858 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 MAP3K7CLP57077 242 aa11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms