RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 VRTNQ9H8Y1 702 aa26.79■■□□□ 1.88
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CAPNS1-204ENST00000587718 CEP83Q9Y592 693 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 PI4K2BG5E9Z4 385 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.88
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CAPNS1-204ENST00000587718 CST3P01034 146 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
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CAPNS1-204ENST00000587718 CISHQ9NSE2 258 aa26.77■■□□□ 1.88
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CAPNS1-204ENST00000587718 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
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CAPNS1-204ENST00000587718 RNF169Q8NCN4 708 aa26.74■■□□□ 1.87
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CAPNS1-204ENST00000587718 ELMO3Q96BJ8 720 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-204ENST00000587718 DCLK3Q9C098 648 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-204ENST00000587718 WDR35Q9P2L0 1181 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-204ENST00000587718 CD207Q9UJ71 328 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-204ENST00000587718 NDC80O14777 642 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-204ENST00000587718 P4HA1P13674 534 aa26.73■■□□□ 1.87
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