RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	TAF1	P21675	1872 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	CASZ1	Q86V15	1759 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A087WWV3	80 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	USP27X	A6NNY8	438 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	TBX3	O15119	743 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	KRT86	O43790	486 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	NMT2	O60551	498 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	MFAP3L	O75121	409 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	KRT37	O76014	449 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	CYP17A1	P05093	508 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	ADH4	P08319	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	CYP2D6	P10635	497 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	MAK	P20794	623 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	KLRK1	P26718	216 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	KRT9	P35527	623 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	PRCP	P42785	496 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	RHBDL3	P58872	404 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	ZBED6	P86452	979 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC6A3	Q01959	620 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	DPT	Q07507	201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	CRHR2	Q13324	411 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	SPA17	Q15506	151 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	CALCRL	Q16602	461 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	LETM2	Q2VYF4	491 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM139	Q8IV31	216 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	MB21D1	Q8N884	522 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	ERMN	Q8TAM6	284 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	P2RX5	Q93086	422 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	MASTL	Q96GX5	879 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	MAML3	Q96JK9	1138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM9	Q9C026	710 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	NYAP2	Q9P242	653 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	PNMA2	Q9UL42	364 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	MYH1	P12882	1939 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	FLT1	P17948	1338 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	SBF2	Q86WG5	1849 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A087X0B3	334 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC151	A5D8V7	595 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM232	C9JQI7	657 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ZBTB5	O15062	677 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CYTH3	O43739	400 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PEX11B	O96011	259 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ASL	P04424	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SRGN	P10124	158 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PDHB	P11177	359 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PRLR	P16471	622 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MUT	P22033	750 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CYP3A7	P24462	503 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CASP14	P31944	242 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	INHBC	P55103	352 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	STX17	P56962	302 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ASIC1	P78348	528 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	GABPA	Q06546	454 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF543	Q08ER8	600 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	IL17A	Q16552	155 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MAP9	Q49MG5	647 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CENPP	Q6IPU0	288 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TBCK	Q8TEA7	893 aa		4.96	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms