RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CLEC4AQ9UMR7 237 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 GPR34Q9UPC5 381 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 SATB2Q9UPW6 733 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 GPR52Q9Y2T5 361 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 MRFAP1Q9Y605 127 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP3.28□□□□□ -1.88
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PTPRM-204ENST00000577468 ROCK1Q13464 1354 aa3.27□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 PMS2P1A4D2B8 440 aa3.27□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 TXNL1O43396 289 aa3.27□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 SULT1B1O43704 296 aa3.27□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 OPN1MWP04001 364 aa3.27□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 PDGFRAP16234 1089 aa3.27□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 SPC24Q8NBT2 197 aa3.27□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 DTNBP1Q96EV8 351 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 FAM167AQ96KS9 214 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 NT5C1BQ96P26 610 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ACAP3Q96P50 834 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 SDF4Q9BRK5 362 aa3.27□□□□□ -1.89
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