RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577001.1

PRPF8-216, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, human

TSL 5

Gene PRPF8, Length 3,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRPF8-216	ENST00000577001	NPTXR	O95502	500 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	LCP1	P13796	627 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	TMPRSS15	P98073	1019 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	CLUL1	Q15846	466 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	GPRASP2	Q96D09	838 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	FAM161B	Q96MY7	647 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	SPATA33	Q96N06	139 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	USP18	Q9UMW8	372 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001		A0A1B0GUA9	196 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	MUT	P22033	750 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	RCN1	Q15293	331 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	TRNP1	Q6NT89	227 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	RINL	Q6ZS11	566 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	FAM83A	Q86UY5	434 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	APOL2	Q9BQE5	337 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	GYG2	O15488	501 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ADCY3	O60266	1144 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	TNNC2	P02585	160 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ARFIP2	P53365	341 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	MUM1	Q2TAK8	710 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ADAM32	Q8TC27	787 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ADM5	C9JUS6	153 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	MCF2L	O15068	1137 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	MICAL2	O94851	1124 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	15.46	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	C3orf20	Q8ND61	904 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	15.46	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		15.46	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		15.46	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		15.46	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		15.46	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	KCNA4	P22459	653 aa		15.46	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	EPHB1	P54762	984 aa		15.46	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	15.46	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	DPYSL3	Q14195	570 aa		15.46	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		15.46	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	FYB2	Q5VWT5	728 aa		15.46	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	15.46	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		15.46	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	P3H4	Q92791	437 aa		15.46	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	TRIM11	Q96F44	468 aa		15.46	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	ZNF358	Q9NW07	568 aa		15.46	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		15.46	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	CFAP73	A6NFT4	308 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	PLSCR1	O15162	318 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	15.45	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	15.45	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	C10orf82	Q8WW14	230 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	EBF4	Q9BQW3	602 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	15.45	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	PIDD1	Q9HB75	910 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	AK5	Q9Y6K8	562 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	NFKBIE	O00221	500 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	15.45	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	AMPD1	P23109	780 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	ADORA2A	P29274	412 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	NAMPT	P43490	491 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	NDST1	P52848	882 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	15.45	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	CHI3L2	Q15782	390 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	PGBD4	Q96DM1	585 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	FAM81B	Q96LP2	452 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	15.45	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	MSC	O60682	206 aa		15.44	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	15.44	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	HAUS5	O94927	633 aa		15.44	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	CALB1	P05937	261 aa		15.44	■□□□□ 0.06

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