RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 TBC1D7Q9P0N9 293 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 ITGA11Q9UKX5 1188 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 ADAMTS20P59510 1910 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 FREM2Q5SZK8 3169 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 GABRDO14764 452 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 PPP1R37O75864 691 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 LMO2P25791 158 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 ANXA13P27216 316 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 FAM171BQ6P995 826 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 C19orf48Q6RUI8 117 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 HVCN1Q96D96 273 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 SPATA17Q96L03 361 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 CRTAC1Q9NQ79 661 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 CFAP97Q9P2B7 532 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 SIX4Q9UIU6 781 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 SLC6A14Q9UN76 642 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF840PA6NDX5 716 aa18.72■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 H3BQV1 296 aa18.72■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 OPHN1O60890 802 aa18.72■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM191BP0C7N4 346 aa18.72■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 ADH5P11766 374 aa18.72■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 DPP6P42658 865 aa18.72■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 SLC7A9P82251 487 aa18.72■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 RBP5P82980 135 aa18.72■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 DUOXA1Q1HG43 343 aa18.72■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 RHBDF2Q6PJF5 856 aa18.72■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 PROSER1Q86XN7 944 aa18.72■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 MINDY1Q8N5J2 469 aa18.72■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa18.72■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 ERLEC1Q96DZ1 483 aa18.72■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 PDE11AQ9HCR9 933 aa18.72■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 KIF3AQ9Y496 699 aa18.72■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 UPK3BL1B0FP48 263 aa18.71■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 UPK3BL2E5RIL1 263 aa18.71■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 H0Y626 953 aa18.71■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 AP5Z1O43299 807 aa18.71■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 TRIM16O95361 564 aa18.71■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 ADH1CP00326 375 aa18.71■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 PDGFRBP09619 1106 aa18.71■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 PFKLP17858 780 aa18.71■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 RDXP35241 583 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 VSTM1Q6UX27 236 aa18.71■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 CAMK1GQ96NX5 476 aa18.71■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 ACCSQ96QU6 501 aa18.71■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 PCIF1Q9H4Z3 704 aa18.71■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 CDH9Q9ULB4 789 aa18.71■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 EXOC7Q9UPT5 735 aa18.71■□□□□ 0.59
CCDC40-211ENST00000574099 F8VP50 259 aa18.7■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 GCNT3O95395 438 aa18.7■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 OLFM2O95897 454 aa18.7■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 SERPINF2P08697 491 aa18.7■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 GRIA2P42262 883 aa18.7■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 WASP42768 502 aa18.7■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 SPDYCQ5MJ68 293 aa18.7■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 LY6G5CQ5SRR4 150 aa18.7■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 NAT16Q8N8M0 369 aa18.7■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 CEP76Q8TAP6 659 aa18.7■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 PCED1BQ96HM7 432 aa18.7■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 CBWD1Q9BRT8 395 aa18.7■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 TTLL2Q9BWV7 592 aa18.7■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 STRA6Q9BX79 667 aa18.7■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 CAPN10Q9HC96 672 aa18.7■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa18.7■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 PTPRJQ12913 1337 aa18.7■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 ITPR1Q14643 2758 aa18.7■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 TRIM66O15016 1216 aa18.69■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 OAS1P00973 400 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 CD59P13987 128 aa18.69■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 GABRG2P18507 467 aa18.69■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 HOXD12P35452 270 aa18.69■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 LONP1P36776 959 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 CASP5P51878 434 aa18.69■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF33AQ06730 810 aa18.69■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 SCAPQ12770 1279 aa18.69■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 TAF10Q12962 218 aa18.69■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 MYO1EQ12965 1108 aa18.69■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF423Q2M1K9 1284 aa18.69■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 MDH1BQ5I0G3 518 aa18.69■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 SYCP3Q8IZU3 236 aa18.69■□□□□ 0.58
CCDC40-211ENST00000574099 PHTF2Q8N3S3 785 aa18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms